Protein–RNA interactions for Protein: P0DML3

CSH2, Chorionic somatomammotropin hormone 2, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSH2P0DML3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSH2P0DML3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSH2P0DML3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSH2P0DML3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSH2P0DML3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSH2P0DML3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSH2P0DML3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CSH2P0DML3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CSH2P0DML3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSH2P0DML3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSH2P0DML3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSH2P0DML3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSH2P0DML3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSH2P0DML3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSH2P0DML3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSH2P0DML3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSH2P0DML3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSH2P0DML3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSH2P0DML3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSH2P0DML3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSH2P0DML3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSH2P0DML3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSH2P0DML3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSH2P0DML3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSH2P0DML3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSH2P0DML3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSH2P0DML3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSH2P0DML3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSH2P0DML3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSH2P0DML3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSH2P0DML3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSH2P0DML3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSH2P0DML3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSH2P0DML3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSH2P0DML3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSH2P0DML3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSH2P0DML3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSH2P0DML3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSH2P0DML3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSH2P0DML3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSH2P0DML3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSH2P0DML3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSH2P0DML3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSH2P0DML3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSH2P0DML3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSH2P0DML3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSH2P0DML3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSH2P0DML3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSH2P0DML3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CSH2P0DML3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSH2P0DML3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSH2P0DML3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSH2P0DML3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CSH2P0DML3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSH2P0DML3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSH2P0DML3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSH2P0DML3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSH2P0DML3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSH2P0DML3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSH2P0DML3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSH2P0DML3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSH2P0DML3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSH2P0DML3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSH2P0DML3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSH2P0DML3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSH2P0DML3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSH2P0DML3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSH2P0DML3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CSH2P0DML3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CSH2P0DML3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CSH2P0DML3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CSH2P0DML3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CSH2P0DML3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CSH2P0DML3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CSH2P0DML3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CSH2P0DML3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CSH2P0DML3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSH2P0DML3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSH2P0DML3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CSH2P0DML3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSH2P0DML3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSH2P0DML3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSH2P0DML3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CSH2P0DML3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CSH2P0DML3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSH2P0DML3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSH2P0DML3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSH2P0DML3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSH2P0DML3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSH2P0DML3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSH2P0DML3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSH2P0DML3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSH2P0DML3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CSH2P0DML3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSH2P0DML3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSH2P0DML3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSH2P0DML3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSH2P0DML3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSH2P0DML3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSH2P0DML3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms