Protein–RNA interactions for Protein: P0CG23

ZNF853, Zinc finger protein 853, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF853P0CG23 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ZNF853P0CG23 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ZNF853P0CG23 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ZNF853P0CG23 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ZNF853P0CG23 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ZNF853P0CG23 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ZNF853P0CG23 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ZNF853P0CG23 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ZNF853P0CG23 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
ZNF853P0CG23 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ZNF853P0CG23 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ZNF853P0CG23 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ZNF853P0CG23 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ZNF853P0CG23 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ZNF853P0CG23 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ZNF853P0CG23 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ZNF853P0CG23 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ZNF853P0CG23 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ZNF853P0CG23 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ZNF853P0CG23 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ZNF853P0CG23 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ZNF853P0CG23 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ZNF853P0CG23 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ZNF853P0CG23 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZNF853P0CG23 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZNF853P0CG23 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZNF853P0CG23 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZNF853P0CG23 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZNF853P0CG23 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZNF853P0CG23 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZNF853P0CG23 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZNF853P0CG23 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZNF853P0CG23 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZNF853P0CG23 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZNF853P0CG23 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZNF853P0CG23 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ZNF853P0CG23 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ZNF853P0CG23 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ZNF853P0CG23 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ZNF853P0CG23 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ZNF853P0CG23 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ZNF853P0CG23 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZNF853P0CG23 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZNF853P0CG23 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZNF853P0CG23 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZNF853P0CG23 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZNF853P0CG23 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZNF853P0CG23 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZNF853P0CG23 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZNF853P0CG23 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZNF853P0CG23 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZNF853P0CG23 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZNF853P0CG23 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZNF853P0CG23 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZNF853P0CG23 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZNF853P0CG23 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZNF853P0CG23 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZNF853P0CG23 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZNF853P0CG23 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZNF853P0CG23 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZNF853P0CG23 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZNF853P0CG23 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZNF853P0CG23 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZNF853P0CG23 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZNF853P0CG23 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ZNF853P0CG23 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ZNF853P0CG23 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ZNF853P0CG23 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ZNF853P0CG23 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ZNF853P0CG23 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZNF853P0CG23 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZNF853P0CG23 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
ZNF853P0CG23 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZNF853P0CG23 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZNF853P0CG23 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZNF853P0CG23 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZNF853P0CG23 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZNF853P0CG23 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZNF853P0CG23 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZNF853P0CG23 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZNF853P0CG23 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZNF853P0CG23 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZNF853P0CG23 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZNF853P0CG23 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZNF853P0CG23 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZNF853P0CG23 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZNF853P0CG23 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZNF853P0CG23 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZNF853P0CG23 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZNF853P0CG23 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZNF853P0CG23 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZNF853P0CG23 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZNF853P0CG23 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZNF853P0CG23 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ZNF853P0CG23 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
ZNF853P0CG23 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ZNF853P0CG23 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ZNF853P0CG23 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ZNF853P0CG23 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ZNF853P0CG23 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms