Protein–RNA interactions for Protein: P0C843

LINC00032, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00032, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00032P0C843 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00032P0C843 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00032P0C843 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00032P0C843 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00032P0C843 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00032P0C843 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00032P0C843 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00032P0C843 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00032P0C843 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00032P0C843 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00032P0C843 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00032P0C843 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00032P0C843 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00032P0C843 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00032P0C843 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00032P0C843 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00032P0C843 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00032P0C843 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00032P0C843 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00032P0C843 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00032P0C843 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00032P0C843 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00032P0C843 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00032P0C843 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00032P0C843 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00032P0C843 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00032P0C843 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00032P0C843 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00032P0C843 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00032P0C843 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00032P0C843 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00032P0C843 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00032P0C843 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC00032P0C843 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC00032P0C843 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC00032P0C843 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC00032P0C843 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00032P0C843 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00032P0C843 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00032P0C843 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00032P0C843 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00032P0C843 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00032P0C843 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00032P0C843 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00032P0C843 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00032P0C843 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00032P0C843 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00032P0C843 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00032P0C843 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00032P0C843 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00032P0C843 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00032P0C843 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00032P0C843 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00032P0C843 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00032P0C843 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00032P0C843 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00032P0C843 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00032P0C843 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00032P0C843 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00032P0C843 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00032P0C843 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00032P0C843 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00032P0C843 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00032P0C843 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00032P0C843 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00032P0C843 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00032P0C843 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00032P0C843 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00032P0C843 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00032P0C843 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00032P0C843 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00032P0C843 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00032P0C843 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00032P0C843 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00032P0C843 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00032P0C843 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00032P0C843 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00032P0C843 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00032P0C843 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00032P0C843 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00032P0C843 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00032P0C843 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00032P0C843 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00032P0C843 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00032P0C843 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00032P0C843 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00032P0C843 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00032P0C843 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00032P0C843 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00032P0C843 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00032P0C843 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00032P0C843 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00032P0C843 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00032P0C843 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00032P0C843 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00032P0C843 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00032P0C843 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00032P0C843 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00032P0C843 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00032P0C843 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms