Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC172P0C7W6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC172P0C7W6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC172P0C7W6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC172P0C7W6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC172P0C7W6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC172P0C7W6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC172P0C7W6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC172P0C7W6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC172P0C7W6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC172P0C7W6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC172P0C7W6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC172P0C7W6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC172P0C7W6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC172P0C7W6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC172P0C7W6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC172P0C7W6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC172P0C7W6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC172P0C7W6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC172P0C7W6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC172P0C7W6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC172P0C7W6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC172P0C7W6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC172P0C7W6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC172P0C7W6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC172P0C7W6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC172P0C7W6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC172P0C7W6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC172P0C7W6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC172P0C7W6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC172P0C7W6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC172P0C7W6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC172P0C7W6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC172P0C7W6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC172P0C7W6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC172P0C7W6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC172P0C7W6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC172P0C7W6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC172P0C7W6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC172P0C7W6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC172P0C7W6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC172P0C7W6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC172P0C7W6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC172P0C7W6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC172P0C7W6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC172P0C7W6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC172P0C7W6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC172P0C7W6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC172P0C7W6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC172P0C7W6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC172P0C7W6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC172P0C7W6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC172P0C7W6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC172P0C7W6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC172P0C7W6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC172P0C7W6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC172P0C7W6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC172P0C7W6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC172P0C7W6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC172P0C7W6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC172P0C7W6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC172P0C7W6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC172P0C7W6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC172P0C7W6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC172P0C7W6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC172P0C7W6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC172P0C7W6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC172P0C7W6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC172P0C7W6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC172P0C7W6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC172P0C7W6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC172P0C7W6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC172P0C7W6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC172P0C7W6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC172P0C7W6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC172P0C7W6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC172P0C7W6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC172P0C7W6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC172P0C7W6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC172P0C7W6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC172P0C7W6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC172P0C7W6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC172P0C7W6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC172P0C7W6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC172P0C7W6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC172P0C7W6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC172P0C7W6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC172P0C7W6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC172P0C7W6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC172P0C7W6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC172P0C7W6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC172P0C7W6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC172P0C7W6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC172P0C7W6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC172P0C7W6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC172P0C7W6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC172P0C7W6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC172P0C7W6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC172P0C7W6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC172P0C7W6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms