Protein–RNA interactions for Protein: P09874

PARP1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP1P09874 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PARP1P09874 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PARP1P09874 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PARP1P09874 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PARP1P09874 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PARP1P09874 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PARP1P09874 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PARP1P09874 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PARP1P09874 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PARP1P09874 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PARP1P09874 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PARP1P09874 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PARP1P09874 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PARP1P09874 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PARP1P09874 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PARP1P09874 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PARP1P09874 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PARP1P09874 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PARP1P09874 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PARP1P09874 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PARP1P09874 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PARP1P09874 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PARP1P09874 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PARP1P09874 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PARP1P09874 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PARP1P09874 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PARP1P09874 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PARP1P09874 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PARP1P09874 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PARP1P09874 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PARP1P09874 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PARP1P09874 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PARP1P09874 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PARP1P09874 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PARP1P09874 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PARP1P09874 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PARP1P09874 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PARP1P09874 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PARP1P09874 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PARP1P09874 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PARP1P09874 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PARP1P09874 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PARP1P09874 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PARP1P09874 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PARP1P09874 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PARP1P09874 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PARP1P09874 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PARP1P09874 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PARP1P09874 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PARP1P09874 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PARP1P09874 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PARP1P09874 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PARP1P09874 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PARP1P09874 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PARP1P09874 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PARP1P09874 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PARP1P09874 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PARP1P09874 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PARP1P09874 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PARP1P09874 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PARP1P09874 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PARP1P09874 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PARP1P09874 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PARP1P09874 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PARP1P09874 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PARP1P09874 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PARP1P09874 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PARP1P09874 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PARP1P09874 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PARP1P09874 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PARP1P09874 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PARP1P09874 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PARP1P09874 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PARP1P09874 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PARP1P09874 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PARP1P09874 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PARP1P09874 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PARP1P09874 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PARP1P09874 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PARP1P09874 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PARP1P09874 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PARP1P09874 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PARP1P09874 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PARP1P09874 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PARP1P09874 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PARP1P09874 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PARP1P09874 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PARP1P09874 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PARP1P09874 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PARP1P09874 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PARP1P09874 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PARP1P09874 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PARP1P09874 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PARP1P09874 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PARP1P09874 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PARP1P09874 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PARP1P09874 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PARP1P09874 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PARP1P09874 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PARP1P09874 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms