Protein–RNA interactions for Protein: P09496

CLTA, Clathrin light chain A, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTAP09496 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLTAP09496 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLTAP09496 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLTAP09496 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLTAP09496 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLTAP09496 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLTAP09496 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLTAP09496 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLTAP09496 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLTAP09496 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
CLTAP09496 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLTAP09496 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLTAP09496 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLTAP09496 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLTAP09496 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLTAP09496 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLTAP09496 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLTAP09496 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLTAP09496 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLTAP09496 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLTAP09496 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLTAP09496 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLTAP09496 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLTAP09496 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLTAP09496 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLTAP09496 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLTAP09496 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLTAP09496 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLTAP09496 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLTAP09496 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLTAP09496 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLTAP09496 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLTAP09496 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CLTAP09496 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLTAP09496 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLTAP09496 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLTAP09496 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLTAP09496 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLTAP09496 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLTAP09496 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLTAP09496 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLTAP09496 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLTAP09496 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLTAP09496 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLTAP09496 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLTAP09496 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLTAP09496 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLTAP09496 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLTAP09496 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLTAP09496 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLTAP09496 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLTAP09496 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLTAP09496 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLTAP09496 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLTAP09496 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLTAP09496 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLTAP09496 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLTAP09496 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLTAP09496 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLTAP09496 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLTAP09496 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLTAP09496 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLTAP09496 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLTAP09496 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CLTAP09496 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CLTAP09496 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLTAP09496 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLTAP09496 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLTAP09496 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLTAP09496 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLTAP09496 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLTAP09496 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLTAP09496 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLTAP09496 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLTAP09496 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLTAP09496 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLTAP09496 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLTAP09496 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLTAP09496 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CLTAP09496 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLTAP09496 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CLTAP09496 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLTAP09496 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLTAP09496 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLTAP09496 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLTAP09496 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLTAP09496 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLTAP09496 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CLTAP09496 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLTAP09496 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLTAP09496 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLTAP09496 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLTAP09496 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLTAP09496 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLTAP09496 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLTAP09496 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLTAP09496 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLTAP09496 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLTAP09496 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLTAP09496 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms