Protein–RNA interactions for Protein: P05423

POLR3D, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3DP05423 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLR3DP05423 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLR3DP05423 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
POLR3DP05423 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLR3DP05423 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLR3DP05423 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLR3DP05423 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLR3DP05423 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLR3DP05423 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLR3DP05423 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
POLR3DP05423 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLR3DP05423 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLR3DP05423 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLR3DP05423 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLR3DP05423 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLR3DP05423 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLR3DP05423 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLR3DP05423 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLR3DP05423 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLR3DP05423 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLR3DP05423 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLR3DP05423 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLR3DP05423 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLR3DP05423 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLR3DP05423 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLR3DP05423 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
POLR3DP05423 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLR3DP05423 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLR3DP05423 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLR3DP05423 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLR3DP05423 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLR3DP05423 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLR3DP05423 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
POLR3DP05423 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
POLR3DP05423 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLR3DP05423 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLR3DP05423 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
POLR3DP05423 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
POLR3DP05423 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
POLR3DP05423 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
POLR3DP05423 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
POLR3DP05423 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLR3DP05423 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLR3DP05423 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLR3DP05423 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLR3DP05423 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLR3DP05423 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR3DP05423 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR3DP05423 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR3DP05423 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR3DP05423 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR3DP05423 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR3DP05423 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR3DP05423 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR3DP05423 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLR3DP05423 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLR3DP05423 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLR3DP05423 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLR3DP05423 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLR3DP05423 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLR3DP05423 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLR3DP05423 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLR3DP05423 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR3DP05423 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR3DP05423 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR3DP05423 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR3DP05423 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR3DP05423 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR3DP05423 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR3DP05423 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLR3DP05423 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLR3DP05423 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLR3DP05423 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLR3DP05423 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLR3DP05423 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLR3DP05423 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLR3DP05423 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLR3DP05423 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLR3DP05423 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLR3DP05423 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLR3DP05423 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLR3DP05423 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLR3DP05423 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
POLR3DP05423 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLR3DP05423 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLR3DP05423 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLR3DP05423 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLR3DP05423 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLR3DP05423 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLR3DP05423 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLR3DP05423 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLR3DP05423 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLR3DP05423 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLR3DP05423 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLR3DP05423 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLR3DP05423 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLR3DP05423 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLR3DP05423 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLR3DP05423 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLR3DP05423 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms