Protein–RNA interactions for Protein: P05166

PCCB, Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCCBP05166 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCCBP05166 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCCBP05166 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCCBP05166 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCCBP05166 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCCBP05166 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCCBP05166 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCCBP05166 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCCBP05166 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCCBP05166 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCCBP05166 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCCBP05166 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PCCBP05166 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCCBP05166 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCCBP05166 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCCBP05166 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCCBP05166 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PCCBP05166 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCCBP05166 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCCBP05166 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCCBP05166 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCCBP05166 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCCBP05166 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCCBP05166 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCCBP05166 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCCBP05166 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PCCBP05166 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCCBP05166 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCCBP05166 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCCBP05166 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCCBP05166 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCCBP05166 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCCBP05166 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCCBP05166 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCCBP05166 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCCBP05166 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCCBP05166 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCCBP05166 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCCBP05166 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCCBP05166 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCCBP05166 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCCBP05166 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCCBP05166 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCCBP05166 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCCBP05166 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCCBP05166 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCCBP05166 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCCBP05166 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCCBP05166 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCCBP05166 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PCCBP05166 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PCCBP05166 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCCBP05166 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCCBP05166 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCCBP05166 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCCBP05166 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCCBP05166 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCCBP05166 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCCBP05166 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCCBP05166 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCCBP05166 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCCBP05166 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCCBP05166 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCCBP05166 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCCBP05166 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCCBP05166 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCCBP05166 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCCBP05166 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCCBP05166 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCCBP05166 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCCBP05166 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PCCBP05166 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCCBP05166 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCCBP05166 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCCBP05166 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCCBP05166 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCCBP05166 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCCBP05166 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCCBP05166 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PCCBP05166 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCCBP05166 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCCBP05166 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCCBP05166 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCCBP05166 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCCBP05166 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCCBP05166 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCCBP05166 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCCBP05166 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCCBP05166 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCCBP05166 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCCBP05166 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCCBP05166 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCCBP05166 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCCBP05166 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCCBP05166 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCCBP05166 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCCBP05166 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCCBP05166 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCCBP05166 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCCBP05166 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms