Protein–RNA interactions for Protein: P04278

SHBG, Sex hormone-binding globulin, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHBGP04278 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHBGP04278 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHBGP04278 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHBGP04278 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHBGP04278 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHBGP04278 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHBGP04278 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SHBGP04278 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHBGP04278 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHBGP04278 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHBGP04278 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHBGP04278 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHBGP04278 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHBGP04278 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHBGP04278 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHBGP04278 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHBGP04278 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHBGP04278 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHBGP04278 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHBGP04278 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHBGP04278 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHBGP04278 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SHBGP04278 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHBGP04278 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHBGP04278 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHBGP04278 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHBGP04278 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHBGP04278 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SHBGP04278 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHBGP04278 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHBGP04278 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHBGP04278 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SHBGP04278 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHBGP04278 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHBGP04278 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHBGP04278 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHBGP04278 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHBGP04278 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHBGP04278 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHBGP04278 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHBGP04278 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHBGP04278 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SHBGP04278 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SHBGP04278 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SHBGP04278 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SHBGP04278 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SHBGP04278 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SHBGP04278 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SHBGP04278 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SHBGP04278 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SHBGP04278 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SHBGP04278 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHBGP04278 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHBGP04278 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SHBGP04278 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHBGP04278 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHBGP04278 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHBGP04278 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SHBGP04278 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHBGP04278 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHBGP04278 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHBGP04278 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHBGP04278 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHBGP04278 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHBGP04278 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHBGP04278 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHBGP04278 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHBGP04278 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHBGP04278 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHBGP04278 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHBGP04278 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHBGP04278 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHBGP04278 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHBGP04278 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHBGP04278 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHBGP04278 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHBGP04278 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHBGP04278 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHBGP04278 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHBGP04278 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHBGP04278 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHBGP04278 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHBGP04278 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHBGP04278 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHBGP04278 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHBGP04278 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHBGP04278 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SHBGP04278 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHBGP04278 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SHBGP04278 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHBGP04278 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHBGP04278 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SHBGP04278 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHBGP04278 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHBGP04278 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHBGP04278 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHBGP04278 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHBGP04278 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHBGP04278 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHBGP04278 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms