Protein–RNA interactions for Protein: P02748

C9, Complement component C9, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9P02748 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9P02748 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9P02748 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9P02748 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C9P02748 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9P02748 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9P02748 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9P02748 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9P02748 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9P02748 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9P02748 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9P02748 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9P02748 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9P02748 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9P02748 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9P02748 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9P02748 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9P02748 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9P02748 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9P02748 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9P02748 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9P02748 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9P02748 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C9P02748 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C9P02748 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C9P02748 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C9P02748 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C9P02748 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C9P02748 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C9P02748 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C9P02748 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C9P02748 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C9P02748 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C9P02748 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C9P02748 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C9P02748 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C9P02748 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C9P02748 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C9P02748 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C9P02748 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C9P02748 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C9P02748 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C9P02748 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C9P02748 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9P02748 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9P02748 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9P02748 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9P02748 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9P02748 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9P02748 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
C9P02748 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9P02748 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9P02748 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9P02748 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9P02748 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9P02748 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9P02748 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9P02748 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9P02748 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9P02748 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9P02748 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9P02748 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C9P02748 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C9P02748 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
C9P02748 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9P02748 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9P02748 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9P02748 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9P02748 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9P02748 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9P02748 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9P02748 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
C9P02748 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9P02748 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9P02748 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
C9P02748 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9P02748 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9P02748 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9P02748 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9P02748 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9P02748 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9P02748 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9P02748 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9P02748 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
C9P02748 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9P02748 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9P02748 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9P02748 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9P02748 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9P02748 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9P02748 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9P02748 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9P02748 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9P02748 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9P02748 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9P02748 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9P02748 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9P02748 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9P02748 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9P02748 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms