Protein–RNA interactions for Protein: P02730

SLC4A1, Band 3 anion transport protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A1P02730 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A1P02730 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A1P02730 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A1P02730 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC4A1P02730 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC4A1P02730 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC4A1P02730 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC4A1P02730 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC4A1P02730 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC4A1P02730 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC4A1P02730 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC4A1P02730 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC4A1P02730 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC4A1P02730 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A1P02730 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A1P02730 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A1P02730 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A1P02730 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A1P02730 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A1P02730 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A1P02730 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A1P02730 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A1P02730 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A1P02730 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A1P02730 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A1P02730 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A1P02730 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC4A1P02730 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC4A1P02730 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC4A1P02730 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC4A1P02730 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC4A1P02730 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC4A1P02730 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC4A1P02730 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC4A1P02730 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC4A1P02730 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC4A1P02730 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC4A1P02730 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC4A1P02730 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC4A1P02730 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC4A1P02730 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A1P02730 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A1P02730 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A1P02730 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A1P02730 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A1P02730 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A1P02730 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A1P02730 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A1P02730 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A1P02730 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A1P02730 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC4A1P02730 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A1P02730 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A1P02730 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A1P02730 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A1P02730 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A1P02730 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A1P02730 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A1P02730 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A1P02730 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A1P02730 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A1P02730 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A1P02730 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A1P02730 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC4A1P02730 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A1P02730 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A1P02730 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A1P02730 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A1P02730 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A1P02730 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A1P02730 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A1P02730 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A1P02730 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A1P02730 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A1P02730 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A1P02730 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A1P02730 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A1P02730 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A1P02730 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC4A1P02730 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A1P02730 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A1P02730 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A1P02730 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A1P02730 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A1P02730 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A1P02730 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A1P02730 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A1P02730 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A1P02730 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A1P02730 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A1P02730 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC4A1P02730 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A1P02730 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A1P02730 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A1P02730 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A1P02730 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A1P02730 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A1P02730 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A1P02730 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC4A1P02730 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms