Protein–RNA interactions for Protein: P01903

HLA-DRA, HLA class II histocompatibility antigen, DR alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DRAP01903 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HLA-DRAP01903 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HLA-DRAP01903 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HLA-DRAP01903 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HLA-DRAP01903 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HLA-DRAP01903 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HLA-DRAP01903 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HLA-DRAP01903 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HLA-DRAP01903 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HLA-DRAP01903 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HLA-DRAP01903 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HLA-DRAP01903 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HLA-DRAP01903 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HLA-DRAP01903 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HLA-DRAP01903 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HLA-DRAP01903 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HLA-DRAP01903 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HLA-DRAP01903 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HLA-DRAP01903 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HLA-DRAP01903 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HLA-DRAP01903 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HLA-DRAP01903 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HLA-DRAP01903 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HLA-DRAP01903 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HLA-DRAP01903 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HLA-DRAP01903 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HLA-DRAP01903 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HLA-DRAP01903 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HLA-DRAP01903 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HLA-DRAP01903 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HLA-DRAP01903 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HLA-DRAP01903 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
HLA-DRAP01903 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HLA-DRAP01903 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HLA-DRAP01903 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HLA-DRAP01903 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HLA-DRAP01903 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HLA-DRAP01903 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HLA-DRAP01903 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HLA-DRAP01903 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HLA-DRAP01903 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HLA-DRAP01903 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HLA-DRAP01903 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HLA-DRAP01903 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HLA-DRAP01903 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HLA-DRAP01903 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HLA-DRAP01903 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HLA-DRAP01903 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HLA-DRAP01903 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HLA-DRAP01903 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HLA-DRAP01903 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HLA-DRAP01903 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HLA-DRAP01903 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HLA-DRAP01903 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HLA-DRAP01903 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HLA-DRAP01903 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HLA-DRAP01903 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HLA-DRAP01903 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HLA-DRAP01903 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HLA-DRAP01903 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HLA-DRAP01903 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HLA-DRAP01903 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HLA-DRAP01903 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HLA-DRAP01903 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HLA-DRAP01903 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HLA-DRAP01903 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HLA-DRAP01903 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HLA-DRAP01903 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HLA-DRAP01903 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HLA-DRAP01903 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HLA-DRAP01903 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HLA-DRAP01903 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HLA-DRAP01903 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HLA-DRAP01903 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HLA-DRAP01903 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HLA-DRAP01903 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HLA-DRAP01903 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HLA-DRAP01903 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HLA-DRAP01903 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HLA-DRAP01903 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HLA-DRAP01903 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HLA-DRAP01903 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HLA-DRAP01903 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HLA-DRAP01903 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HLA-DRAP01903 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HLA-DRAP01903 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HLA-DRAP01903 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HLA-DRAP01903 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HLA-DRAP01903 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HLA-DRAP01903 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HLA-DRAP01903 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HLA-DRAP01903 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HLA-DRAP01903 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HLA-DRAP01903 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HLA-DRAP01903 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HLA-DRAP01903 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HLA-DRAP01903 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HLA-DRAP01903 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HLA-DRAP01903 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HLA-DRAP01903 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms