Protein–RNA interactions for Protein: P00480

OTC, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTCP00480 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTCP00480 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTCP00480 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTCP00480 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTCP00480 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTCP00480 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTCP00480 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTCP00480 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTCP00480 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTCP00480 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTCP00480 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTCP00480 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
OTCP00480 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTCP00480 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTCP00480 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTCP00480 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTCP00480 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTCP00480 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTCP00480 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTCP00480 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTCP00480 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTCP00480 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTCP00480 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTCP00480 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTCP00480 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
OTCP00480 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
OTCP00480 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
OTCP00480 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
OTCP00480 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
OTCP00480 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTCP00480 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTCP00480 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTCP00480 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTCP00480 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTCP00480 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTCP00480 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTCP00480 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTCP00480 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTCP00480 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTCP00480 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTCP00480 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTCP00480 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTCP00480 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTCP00480 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTCP00480 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTCP00480 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTCP00480 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTCP00480 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTCP00480 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTCP00480 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTCP00480 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
OTCP00480 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTCP00480 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTCP00480 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTCP00480 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTCP00480 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTCP00480 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTCP00480 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTCP00480 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTCP00480 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTCP00480 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTCP00480 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTCP00480 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTCP00480 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
OTCP00480 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTCP00480 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTCP00480 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTCP00480 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTCP00480 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTCP00480 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTCP00480 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTCP00480 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTCP00480 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTCP00480 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTCP00480 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTCP00480 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTCP00480 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTCP00480 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OTCP00480 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OTCP00480 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OTCP00480 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
OTCP00480 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OTCP00480 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OTCP00480 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
OTCP00480 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OTCP00480 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
OTCP00480 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
OTCP00480 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
OTCP00480 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
OTCP00480 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTCP00480 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTCP00480 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTCP00480 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTCP00480 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
OTCP00480 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTCP00480 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTCP00480 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTCP00480 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTCP00480 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
OTCP00480 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms