Protein–RNA interactions for Protein: O96013

PAK4, Serine/threonine-protein kinase PAK 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAK4O96013 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAK4O96013 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAK4O96013 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAK4O96013 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAK4O96013 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAK4O96013 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAK4O96013 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PAK4O96013 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAK4O96013 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAK4O96013 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAK4O96013 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PAK4O96013 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAK4O96013 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAK4O96013 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAK4O96013 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAK4O96013 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAK4O96013 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAK4O96013 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAK4O96013 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAK4O96013 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAK4O96013 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAK4O96013 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAK4O96013 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAK4O96013 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAK4O96013 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAK4O96013 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAK4O96013 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAK4O96013 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAK4O96013 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAK4O96013 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAK4O96013 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAK4O96013 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAK4O96013 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAK4O96013 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAK4O96013 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAK4O96013 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAK4O96013 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAK4O96013 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAK4O96013 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAK4O96013 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAK4O96013 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAK4O96013 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAK4O96013 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAK4O96013 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PAK4O96013 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAK4O96013 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAK4O96013 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAK4O96013 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAK4O96013 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAK4O96013 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PAK4O96013 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAK4O96013 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PAK4O96013 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PAK4O96013 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PAK4O96013 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PAK4O96013 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PAK4O96013 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PAK4O96013 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PAK4O96013 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PAK4O96013 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAK4O96013 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAK4O96013 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PAK4O96013 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAK4O96013 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PAK4O96013 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAK4O96013 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAK4O96013 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAK4O96013 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAK4O96013 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAK4O96013 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAK4O96013 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAK4O96013 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAK4O96013 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAK4O96013 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAK4O96013 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAK4O96013 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAK4O96013 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PAK4O96013 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PAK4O96013 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAK4O96013 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAK4O96013 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAK4O96013 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PAK4O96013 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PAK4O96013 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PAK4O96013 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PAK4O96013 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PAK4O96013 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PAK4O96013 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PAK4O96013 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PAK4O96013 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PAK4O96013 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PAK4O96013 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PAK4O96013 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PAK4O96013 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAK4O96013 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAK4O96013 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAK4O96013 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAK4O96013 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAK4O96013 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAK4O96013 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms