Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYF2O95926 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYF2O95926 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYF2O95926 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYF2O95926 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYF2O95926 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SYF2O95926 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYF2O95926 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYF2O95926 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYF2O95926 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYF2O95926 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYF2O95926 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYF2O95926 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYF2O95926 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYF2O95926 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYF2O95926 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYF2O95926 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYF2O95926 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYF2O95926 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYF2O95926 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYF2O95926 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYF2O95926 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYF2O95926 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYF2O95926 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SYF2O95926 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SYF2O95926 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYF2O95926 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYF2O95926 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYF2O95926 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYF2O95926 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYF2O95926 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYF2O95926 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYF2O95926 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYF2O95926 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYF2O95926 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYF2O95926 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SYF2O95926 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYF2O95926 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYF2O95926 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYF2O95926 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYF2O95926 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYF2O95926 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYF2O95926 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYF2O95926 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYF2O95926 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SYF2O95926 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYF2O95926 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYF2O95926 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYF2O95926 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYF2O95926 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYF2O95926 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYF2O95926 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYF2O95926 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYF2O95926 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYF2O95926 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYF2O95926 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYF2O95926 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYF2O95926 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYF2O95926 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYF2O95926 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SYF2O95926 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYF2O95926 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYF2O95926 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYF2O95926 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYF2O95926 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYF2O95926 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYF2O95926 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYF2O95926 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYF2O95926 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYF2O95926 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYF2O95926 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYF2O95926 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYF2O95926 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYF2O95926 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYF2O95926 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYF2O95926 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYF2O95926 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYF2O95926 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYF2O95926 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYF2O95926 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYF2O95926 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYF2O95926 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYF2O95926 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYF2O95926 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYF2O95926 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYF2O95926 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYF2O95926 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYF2O95926 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYF2O95926 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYF2O95926 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYF2O95926 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYF2O95926 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYF2O95926 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYF2O95926 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYF2O95926 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYF2O95926 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYF2O95926 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYF2O95926 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYF2O95926 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYF2O95926 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms