Protein–RNA interactions for Protein: O95803

NDST3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST3O95803 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDST3O95803 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDST3O95803 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDST3O95803 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDST3O95803 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDST3O95803 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDST3O95803 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDST3O95803 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDST3O95803 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDST3O95803 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDST3O95803 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDST3O95803 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDST3O95803 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDST3O95803 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDST3O95803 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDST3O95803 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDST3O95803 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDST3O95803 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDST3O95803 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDST3O95803 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDST3O95803 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDST3O95803 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDST3O95803 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDST3O95803 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDST3O95803 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDST3O95803 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDST3O95803 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDST3O95803 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDST3O95803 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDST3O95803 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDST3O95803 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDST3O95803 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NDST3O95803 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NDST3O95803 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NDST3O95803 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDST3O95803 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDST3O95803 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDST3O95803 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDST3O95803 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDST3O95803 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDST3O95803 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDST3O95803 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDST3O95803 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDST3O95803 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDST3O95803 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDST3O95803 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDST3O95803 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDST3O95803 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDST3O95803 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NDST3O95803 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDST3O95803 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDST3O95803 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDST3O95803 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDST3O95803 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDST3O95803 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDST3O95803 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDST3O95803 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDST3O95803 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDST3O95803 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDST3O95803 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDST3O95803 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NDST3O95803 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NDST3O95803 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDST3O95803 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDST3O95803 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDST3O95803 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDST3O95803 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDST3O95803 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDST3O95803 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDST3O95803 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDST3O95803 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NDST3O95803 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDST3O95803 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDST3O95803 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDST3O95803 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDST3O95803 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDST3O95803 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDST3O95803 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NDST3O95803 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDST3O95803 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDST3O95803 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDST3O95803 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDST3O95803 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDST3O95803 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDST3O95803 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDST3O95803 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDST3O95803 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDST3O95803 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDST3O95803 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDST3O95803 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDST3O95803 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDST3O95803 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDST3O95803 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDST3O95803 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDST3O95803 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDST3O95803 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDST3O95803 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDST3O95803 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDST3O95803 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDST3O95803 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms