Protein–RNA interactions for Protein: O95754

SEMA4F, Semaphorin-4F, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4FO95754 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA4FO95754 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA4FO95754 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA4FO95754 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA4FO95754 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA4FO95754 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA4FO95754 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA4FO95754 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA4FO95754 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA4FO95754 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA4FO95754 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA4FO95754 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA4FO95754 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA4FO95754 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA4FO95754 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA4FO95754 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA4FO95754 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA4FO95754 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA4FO95754 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA4FO95754 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA4FO95754 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA4FO95754 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA4FO95754 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA4FO95754 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA4FO95754 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA4FO95754 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA4FO95754 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA4FO95754 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA4FO95754 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA4FO95754 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA4FO95754 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA4FO95754 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA4FO95754 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA4FO95754 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA4FO95754 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA4FO95754 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA4FO95754 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA4FO95754 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA4FO95754 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA4FO95754 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA4FO95754 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA4FO95754 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA4FO95754 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA4FO95754 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA4FO95754 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA4FO95754 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA4FO95754 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA4FO95754 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA4FO95754 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA4FO95754 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA4FO95754 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA4FO95754 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA4FO95754 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA4FO95754 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA4FO95754 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA4FO95754 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA4FO95754 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA4FO95754 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA4FO95754 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA4FO95754 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA4FO95754 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA4FO95754 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA4FO95754 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA4FO95754 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA4FO95754 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA4FO95754 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA4FO95754 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA4FO95754 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA4FO95754 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA4FO95754 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA4FO95754 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA4FO95754 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA4FO95754 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA4FO95754 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA4FO95754 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA4FO95754 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA4FO95754 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA4FO95754 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA4FO95754 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA4FO95754 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA4FO95754 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA4FO95754 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA4FO95754 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA4FO95754 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA4FO95754 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA4FO95754 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA4FO95754 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA4FO95754 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA4FO95754 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA4FO95754 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA4FO95754 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SEMA4FO95754 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SEMA4FO95754 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SEMA4FO95754 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SEMA4FO95754 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEMA4FO95754 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEMA4FO95754 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEMA4FO95754 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEMA4FO95754 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SEMA4FO95754 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms