Protein–RNA interactions for Protein: O95721

SNAP29, Synaptosomal-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP29O95721 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNAP29O95721 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNAP29O95721 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SNAP29O95721 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SNAP29O95721 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNAP29O95721 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNAP29O95721 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNAP29O95721 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNAP29O95721 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNAP29O95721 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNAP29O95721 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SNAP29O95721 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNAP29O95721 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNAP29O95721 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNAP29O95721 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNAP29O95721 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNAP29O95721 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNAP29O95721 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNAP29O95721 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNAP29O95721 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNAP29O95721 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNAP29O95721 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNAP29O95721 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNAP29O95721 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNAP29O95721 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNAP29O95721 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNAP29O95721 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SNAP29O95721 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNAP29O95721 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SNAP29O95721 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNAP29O95721 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNAP29O95721 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNAP29O95721 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNAP29O95721 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNAP29O95721 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNAP29O95721 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNAP29O95721 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNAP29O95721 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNAP29O95721 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNAP29O95721 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNAP29O95721 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNAP29O95721 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNAP29O95721 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNAP29O95721 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNAP29O95721 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNAP29O95721 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNAP29O95721 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SNAP29O95721 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNAP29O95721 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNAP29O95721 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNAP29O95721 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNAP29O95721 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNAP29O95721 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNAP29O95721 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNAP29O95721 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNAP29O95721 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNAP29O95721 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNAP29O95721 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNAP29O95721 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SNAP29O95721 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNAP29O95721 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNAP29O95721 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNAP29O95721 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNAP29O95721 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNAP29O95721 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNAP29O95721 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNAP29O95721 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNAP29O95721 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNAP29O95721 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNAP29O95721 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNAP29O95721 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNAP29O95721 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNAP29O95721 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNAP29O95721 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNAP29O95721 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNAP29O95721 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNAP29O95721 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNAP29O95721 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNAP29O95721 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNAP29O95721 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNAP29O95721 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNAP29O95721 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNAP29O95721 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNAP29O95721 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNAP29O95721 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNAP29O95721 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNAP29O95721 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNAP29O95721 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNAP29O95721 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNAP29O95721 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNAP29O95721 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNAP29O95721 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNAP29O95721 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
SNAP29O95721 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNAP29O95721 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNAP29O95721 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNAP29O95721 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNAP29O95721 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SNAP29O95721 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNAP29O95721 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms