Protein–RNA interactions for Protein: O95696

BRD1, Bromodomain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD1O95696 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BRD1O95696 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BRD1O95696 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BRD1O95696 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BRD1O95696 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BRD1O95696 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BRD1O95696 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BRD1O95696 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BRD1O95696 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BRD1O95696 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BRD1O95696 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BRD1O95696 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BRD1O95696 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BRD1O95696 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
BRD1O95696 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
BRD1O95696 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BRD1O95696 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BRD1O95696 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BRD1O95696 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
BRD1O95696 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BRD1O95696 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
BRD1O95696 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BRD1O95696 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
BRD1O95696 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BRD1O95696 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BRD1O95696 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BRD1O95696 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
BRD1O95696 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BRD1O95696 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
BRD1O95696 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
BRD1O95696 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
BRD1O95696 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
BRD1O95696 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BRD1O95696 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BRD1O95696 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BRD1O95696 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BRD1O95696 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BRD1O95696 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
BRD1O95696 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BRD1O95696 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BRD1O95696 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
BRD1O95696 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
BRD1O95696 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRD1O95696 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRD1O95696 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
BRD1O95696 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRD1O95696 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRD1O95696 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRD1O95696 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRD1O95696 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
BRD1O95696 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRD1O95696 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRD1O95696 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRD1O95696 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRD1O95696 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRD1O95696 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRD1O95696 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRD1O95696 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRD1O95696 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRD1O95696 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRD1O95696 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRD1O95696 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRD1O95696 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRD1O95696 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRD1O95696 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRD1O95696 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRD1O95696 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRD1O95696 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRD1O95696 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRD1O95696 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRD1O95696 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRD1O95696 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRD1O95696 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRD1O95696 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRD1O95696 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRD1O95696 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRD1O95696 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRD1O95696 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRD1O95696 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRD1O95696 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRD1O95696 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRD1O95696 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRD1O95696 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BRD1O95696 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BRD1O95696 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BRD1O95696 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
BRD1O95696 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
BRD1O95696 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
BRD1O95696 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
BRD1O95696 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
BRD1O95696 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
BRD1O95696 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRD1O95696 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRD1O95696 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRD1O95696 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRD1O95696 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRD1O95696 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRD1O95696 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRD1O95696 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRD1O95696 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms