Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
POLR1AO95602 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
POLR1AO95602 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
POLR1AO95602 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC33.47■■■□□ 2.95
POLR1AO95602 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
POLR1AO95602 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
POLR1AO95602 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
POLR1AO95602 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
POLR1AO95602 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
POLR1AO95602 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
POLR1AO95602 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
POLR1AO95602 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
POLR1AO95602 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
POLR1AO95602 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
POLR1AO95602 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
POLR1AO95602 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
POLR1AO95602 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
POLR1AO95602 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
POLR1AO95602 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
POLR1AO95602 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
POLR1AO95602 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
POLR1AO95602 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
POLR1AO95602 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.44■■■□□ 2.94
POLR1AO95602 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
POLR1AO95602 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
POLR1AO95602 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
POLR1AO95602 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
POLR1AO95602 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
POLR1AO95602 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
POLR1AO95602 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
POLR1AO95602 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
POLR1AO95602 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
POLR1AO95602 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
POLR1AO95602 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
POLR1AO95602 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
POLR1AO95602 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
POLR1AO95602 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
POLR1AO95602 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
POLR1AO95602 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
POLR1AO95602 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
POLR1AO95602 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
POLR1AO95602 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
POLR1AO95602 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
POLR1AO95602 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
POLR1AO95602 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
POLR1AO95602 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
POLR1AO95602 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
POLR1AO95602 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
POLR1AO95602 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC33.41■■■□□ 2.94
POLR1AO95602 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
POLR1AO95602 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
POLR1AO95602 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
POLR1AO95602 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
POLR1AO95602 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
POLR1AO95602 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
POLR1AO95602 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
POLR1AO95602 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
POLR1AO95602 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
POLR1AO95602 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
POLR1AO95602 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
POLR1AO95602 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
POLR1AO95602 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
POLR1AO95602 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
POLR1AO95602 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
POLR1AO95602 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
POLR1AO95602 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
POLR1AO95602 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
POLR1AO95602 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
POLR1AO95602 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
POLR1AO95602 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC33.38■■■□□ 2.93
POLR1AO95602 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
POLR1AO95602 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
POLR1AO95602 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
POLR1AO95602 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
POLR1AO95602 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
POLR1AO95602 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
POLR1AO95602 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
POLR1AO95602 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
POLR1AO95602 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
POLR1AO95602 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
POLR1AO95602 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
POLR1AO95602 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
POLR1AO95602 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
POLR1AO95602 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
POLR1AO95602 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
POLR1AO95602 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
POLR1AO95602 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
POLR1AO95602 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
POLR1AO95602 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
POLR1AO95602 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
POLR1AO95602 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
POLR1AO95602 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
POLR1AO95602 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
POLR1AO95602 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
POLR1AO95602 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
POLR1AO95602 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
POLR1AO95602 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
POLR1AO95602 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
POLR1AO95602 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
POLR1AO95602 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms