Protein–RNA interactions for Protein: O95521

PRAMEF1, PRAME family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF1O95521 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF1O95521 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF1O95521 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF1O95521 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF1O95521 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF1O95521 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF1O95521 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF1O95521 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF1O95521 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF1O95521 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF1O95521 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF1O95521 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF1O95521 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF1O95521 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF1O95521 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF1O95521 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF1O95521 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF1O95521 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF1O95521 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF1O95521 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF1O95521 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF1O95521 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF1O95521 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF1O95521 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF1O95521 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF1O95521 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF1O95521 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF1O95521 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF1O95521 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF1O95521 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF1O95521 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF1O95521 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF1O95521 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF1O95521 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF1O95521 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF1O95521 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF1O95521 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF1O95521 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF1O95521 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF1O95521 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF1O95521 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF1O95521 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF1O95521 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF1O95521 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF1O95521 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF1O95521 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF1O95521 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF1O95521 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF1O95521 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF1O95521 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF1O95521 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF1O95521 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF1O95521 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF1O95521 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF1O95521 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF1O95521 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF1O95521 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF1O95521 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF1O95521 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF1O95521 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF1O95521 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRAMEF1O95521 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF1O95521 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF1O95521 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF1O95521 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF1O95521 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF1O95521 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF1O95521 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF1O95521 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF1O95521 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF1O95521 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF1O95521 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF1O95521 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF1O95521 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF1O95521 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF1O95521 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF1O95521 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF1O95521 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF1O95521 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF1O95521 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF1O95521 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF1O95521 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF1O95521 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF1O95521 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF1O95521 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF1O95521 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF1O95521 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF1O95521 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF1O95521 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF1O95521 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF1O95521 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF1O95521 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF1O95521 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF1O95521 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF1O95521 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF1O95521 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF1O95521 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF1O95521 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF1O95521 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF1O95521 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms