Protein–RNA interactions for Protein: O95409

ZIC2, Zinc finger protein ZIC 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC2O95409 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZIC2O95409 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZIC2O95409 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZIC2O95409 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ZIC2O95409 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZIC2O95409 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZIC2O95409 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZIC2O95409 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ZIC2O95409 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZIC2O95409 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZIC2O95409 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZIC2O95409 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ZIC2O95409 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZIC2O95409 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZIC2O95409 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ZIC2O95409 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZIC2O95409 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZIC2O95409 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZIC2O95409 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZIC2O95409 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZIC2O95409 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZIC2O95409 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZIC2O95409 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZIC2O95409 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZIC2O95409 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZIC2O95409 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZIC2O95409 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZIC2O95409 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZIC2O95409 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZIC2O95409 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZIC2O95409 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZIC2O95409 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZIC2O95409 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ZIC2O95409 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZIC2O95409 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZIC2O95409 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZIC2O95409 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZIC2O95409 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZIC2O95409 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZIC2O95409 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZIC2O95409 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZIC2O95409 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZIC2O95409 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZIC2O95409 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZIC2O95409 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZIC2O95409 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZIC2O95409 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZIC2O95409 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZIC2O95409 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZIC2O95409 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZIC2O95409 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZIC2O95409 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZIC2O95409 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ZIC2O95409 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZIC2O95409 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ZIC2O95409 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZIC2O95409 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZIC2O95409 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZIC2O95409 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZIC2O95409 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZIC2O95409 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZIC2O95409 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ZIC2O95409 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ZIC2O95409 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZIC2O95409 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZIC2O95409 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZIC2O95409 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZIC2O95409 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZIC2O95409 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZIC2O95409 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZIC2O95409 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZIC2O95409 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ZIC2O95409 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ZIC2O95409 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZIC2O95409 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZIC2O95409 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZIC2O95409 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZIC2O95409 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZIC2O95409 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZIC2O95409 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZIC2O95409 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZIC2O95409 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZIC2O95409 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZIC2O95409 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZIC2O95409 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZIC2O95409 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ZIC2O95409 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZIC2O95409 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZIC2O95409 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZIC2O95409 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZIC2O95409 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZIC2O95409 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZIC2O95409 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZIC2O95409 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZIC2O95409 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZIC2O95409 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZIC2O95409 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZIC2O95409 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZIC2O95409 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZIC2O95409 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms