Protein–RNA interactions for Protein: O94983

CAMTA2, Calmodulin-binding transcription activator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA2O94983 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CAMTA2O94983 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CAMTA2O94983 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CAMTA2O94983 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CAMTA2O94983 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CAMTA2O94983 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CAMTA2O94983 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CAMTA2O94983 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CAMTA2O94983 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CAMTA2O94983 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CAMTA2O94983 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CAMTA2O94983 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CAMTA2O94983 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CAMTA2O94983 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CAMTA2O94983 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CAMTA2O94983 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CAMTA2O94983 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CAMTA2O94983 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CAMTA2O94983 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CAMTA2O94983 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CAMTA2O94983 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CAMTA2O94983 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CAMTA2O94983 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CAMTA2O94983 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CAMTA2O94983 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CAMTA2O94983 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CAMTA2O94983 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CAMTA2O94983 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CAMTA2O94983 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CAMTA2O94983 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CAMTA2O94983 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CAMTA2O94983 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CAMTA2O94983 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CAMTA2O94983 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CAMTA2O94983 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CAMTA2O94983 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CAMTA2O94983 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CAMTA2O94983 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CAMTA2O94983 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CAMTA2O94983 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CAMTA2O94983 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CAMTA2O94983 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CAMTA2O94983 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CAMTA2O94983 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CAMTA2O94983 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CAMTA2O94983 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CAMTA2O94983 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CAMTA2O94983 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CAMTA2O94983 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CAMTA2O94983 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CAMTA2O94983 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CAMTA2O94983 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CAMTA2O94983 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CAMTA2O94983 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CAMTA2O94983 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CAMTA2O94983 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CAMTA2O94983 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CAMTA2O94983 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CAMTA2O94983 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CAMTA2O94983 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CAMTA2O94983 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CAMTA2O94983 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CAMTA2O94983 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CAMTA2O94983 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CAMTA2O94983 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.2
CAMTA2O94983 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CAMTA2O94983 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CAMTA2O94983 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CAMTA2O94983 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CAMTA2O94983 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CAMTA2O94983 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CAMTA2O94983 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CAMTA2O94983 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CAMTA2O94983 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CAMTA2O94983 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CAMTA2O94983 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CAMTA2O94983 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CAMTA2O94983 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CAMTA2O94983 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CAMTA2O94983 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CAMTA2O94983 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CAMTA2O94983 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CAMTA2O94983 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CAMTA2O94983 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CAMTA2O94983 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CAMTA2O94983 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CAMTA2O94983 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CAMTA2O94983 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CAMTA2O94983 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CAMTA2O94983 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CAMTA2O94983 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CAMTA2O94983 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CAMTA2O94983 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CAMTA2O94983 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CAMTA2O94983 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CAMTA2O94983 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CAMTA2O94983 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CAMTA2O94983 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CAMTA2O94983 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CAMTA2O94983 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms