Protein–RNA interactions for Protein: O76039

CDKL5, Cyclin-dependent kinase-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL5O76039 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDKL5O76039 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDKL5O76039 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDKL5O76039 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDKL5O76039 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDKL5O76039 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDKL5O76039 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDKL5O76039 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDKL5O76039 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CDKL5O76039 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDKL5O76039 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDKL5O76039 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDKL5O76039 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDKL5O76039 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDKL5O76039 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDKL5O76039 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDKL5O76039 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDKL5O76039 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDKL5O76039 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDKL5O76039 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDKL5O76039 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDKL5O76039 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDKL5O76039 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDKL5O76039 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDKL5O76039 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDKL5O76039 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CDKL5O76039 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDKL5O76039 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDKL5O76039 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDKL5O76039 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CDKL5O76039 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDKL5O76039 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDKL5O76039 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDKL5O76039 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDKL5O76039 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDKL5O76039 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDKL5O76039 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDKL5O76039 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDKL5O76039 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDKL5O76039 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDKL5O76039 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDKL5O76039 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDKL5O76039 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDKL5O76039 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDKL5O76039 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDKL5O76039 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDKL5O76039 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDKL5O76039 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDKL5O76039 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDKL5O76039 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDKL5O76039 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDKL5O76039 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDKL5O76039 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDKL5O76039 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDKL5O76039 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDKL5O76039 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDKL5O76039 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDKL5O76039 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDKL5O76039 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDKL5O76039 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDKL5O76039 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDKL5O76039 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDKL5O76039 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CDKL5O76039 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CDKL5O76039 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDKL5O76039 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDKL5O76039 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDKL5O76039 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDKL5O76039 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDKL5O76039 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDKL5O76039 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDKL5O76039 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDKL5O76039 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDKL5O76039 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDKL5O76039 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDKL5O76039 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDKL5O76039 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDKL5O76039 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDKL5O76039 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDKL5O76039 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDKL5O76039 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDKL5O76039 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDKL5O76039 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDKL5O76039 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDKL5O76039 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CDKL5O76039 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDKL5O76039 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDKL5O76039 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CDKL5O76039 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDKL5O76039 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDKL5O76039 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDKL5O76039 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDKL5O76039 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDKL5O76039 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDKL5O76039 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDKL5O76039 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDKL5O76039 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDKL5O76039 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDKL5O76039 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CDKL5O76039 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1535 ms