Protein–RNA interactions for Protein: O76015

KRT38, Keratin, type I cuticular Ha8, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT38O76015 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT38O76015 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT38O76015 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT38O76015 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT38O76015 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT38O76015 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT38O76015 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT38O76015 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT38O76015 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT38O76015 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT38O76015 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT38O76015 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT38O76015 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT38O76015 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT38O76015 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT38O76015 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT38O76015 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT38O76015 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT38O76015 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT38O76015 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT38O76015 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT38O76015 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT38O76015 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT38O76015 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT38O76015 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT38O76015 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT38O76015 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT38O76015 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT38O76015 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT38O76015 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT38O76015 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT38O76015 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT38O76015 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT38O76015 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT38O76015 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT38O76015 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT38O76015 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KRT38O76015 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KRT38O76015 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KRT38O76015 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT38O76015 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT38O76015 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT38O76015 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT38O76015 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT38O76015 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT38O76015 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT38O76015 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT38O76015 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT38O76015 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT38O76015 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT38O76015 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT38O76015 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT38O76015 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT38O76015 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT38O76015 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT38O76015 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT38O76015 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT38O76015 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT38O76015 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT38O76015 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT38O76015 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT38O76015 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT38O76015 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT38O76015 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT38O76015 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT38O76015 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT38O76015 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT38O76015 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT38O76015 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT38O76015 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT38O76015 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT38O76015 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT38O76015 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT38O76015 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT38O76015 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT38O76015 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT38O76015 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT38O76015 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT38O76015 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT38O76015 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT38O76015 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT38O76015 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT38O76015 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT38O76015 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT38O76015 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT38O76015 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT38O76015 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT38O76015 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT38O76015 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT38O76015 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT38O76015 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT38O76015 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT38O76015 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT38O76015 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT38O76015 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT38O76015 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT38O76015 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT38O76015 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT38O76015 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT38O76015 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms