Protein–RNA interactions for Protein: O76011

KRT34, Keratin, type I cuticular Ha4, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT34O76011 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT34O76011 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT34O76011 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT34O76011 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT34O76011 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT34O76011 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT34O76011 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT34O76011 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT34O76011 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT34O76011 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT34O76011 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT34O76011 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT34O76011 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT34O76011 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT34O76011 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT34O76011 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT34O76011 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT34O76011 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT34O76011 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT34O76011 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT34O76011 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT34O76011 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT34O76011 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT34O76011 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT34O76011 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT34O76011 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT34O76011 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT34O76011 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT34O76011 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT34O76011 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT34O76011 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT34O76011 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT34O76011 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KRT34O76011 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT34O76011 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT34O76011 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT34O76011 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT34O76011 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT34O76011 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT34O76011 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT34O76011 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT34O76011 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT34O76011 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT34O76011 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT34O76011 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT34O76011 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT34O76011 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT34O76011 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KRT34O76011 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT34O76011 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT34O76011 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT34O76011 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT34O76011 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT34O76011 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT34O76011 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT34O76011 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT34O76011 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT34O76011 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT34O76011 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT34O76011 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT34O76011 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT34O76011 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT34O76011 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT34O76011 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT34O76011 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT34O76011 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT34O76011 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT34O76011 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT34O76011 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT34O76011 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT34O76011 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT34O76011 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT34O76011 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT34O76011 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT34O76011 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT34O76011 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT34O76011 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT34O76011 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT34O76011 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT34O76011 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT34O76011 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT34O76011 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT34O76011 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT34O76011 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT34O76011 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT34O76011 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT34O76011 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT34O76011 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT34O76011 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT34O76011 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT34O76011 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT34O76011 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT34O76011 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT34O76011 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT34O76011 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT34O76011 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT34O76011 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT34O76011 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT34O76011 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT34O76011 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms