Protein–RNA interactions for Protein: O75586

MED6, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED6O75586 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MED6O75586 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MED6O75586 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MED6O75586 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MED6O75586 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MED6O75586 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MED6O75586 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MED6O75586 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MED6O75586 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MED6O75586 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MED6O75586 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MED6O75586 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MED6O75586 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MED6O75586 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MED6O75586 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MED6O75586 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MED6O75586 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MED6O75586 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MED6O75586 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MED6O75586 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MED6O75586 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MED6O75586 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
MED6O75586 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MED6O75586 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
MED6O75586 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MED6O75586 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MED6O75586 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
MED6O75586 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MED6O75586 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MED6O75586 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MED6O75586 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MED6O75586 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MED6O75586 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MED6O75586 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MED6O75586 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MED6O75586 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MED6O75586 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MED6O75586 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MED6O75586 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MED6O75586 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MED6O75586 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MED6O75586 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MED6O75586 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MED6O75586 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MED6O75586 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
MED6O75586 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MED6O75586 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MED6O75586 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MED6O75586 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MED6O75586 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MED6O75586 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MED6O75586 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MED6O75586 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MED6O75586 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MED6O75586 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MED6O75586 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MED6O75586 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MED6O75586 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MED6O75586 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MED6O75586 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MED6O75586 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MED6O75586 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MED6O75586 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MED6O75586 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MED6O75586 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MED6O75586 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
MED6O75586 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MED6O75586 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MED6O75586 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MED6O75586 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MED6O75586 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MED6O75586 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MED6O75586 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MED6O75586 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MED6O75586 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
MED6O75586 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MED6O75586 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MED6O75586 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MED6O75586 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MED6O75586 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MED6O75586 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MED6O75586 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MED6O75586 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MED6O75586 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MED6O75586 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MED6O75586 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MED6O75586 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MED6O75586 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MED6O75586 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MED6O75586 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MED6O75586 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MED6O75586 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MED6O75586 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MED6O75586 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MED6O75586 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MED6O75586 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MED6O75586 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MED6O75586 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MED6O75586 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MED6O75586 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.8 ms