Protein–RNA interactions for Protein: O75508

CLDN11, Claudin-11, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11O75508 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CLDN11O75508 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN11O75508 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN11O75508 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN11O75508 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN11O75508 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN11O75508 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDN11O75508 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDN11O75508 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDN11O75508 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDN11O75508 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDN11O75508 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDN11O75508 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDN11O75508 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDN11O75508 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN11O75508 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN11O75508 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN11O75508 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN11O75508 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN11O75508 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN11O75508 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN11O75508 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN11O75508 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN11O75508 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN11O75508 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN11O75508 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN11O75508 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN11O75508 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN11O75508 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN11O75508 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN11O75508 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN11O75508 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN11O75508 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN11O75508 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN11O75508 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDN11O75508 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDN11O75508 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDN11O75508 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDN11O75508 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDN11O75508 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDN11O75508 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLDN11O75508 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLDN11O75508 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLDN11O75508 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLDN11O75508 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLDN11O75508 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLDN11O75508 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CLDN11O75508 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLDN11O75508 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLDN11O75508 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLDN11O75508 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLDN11O75508 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLDN11O75508 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLDN11O75508 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLDN11O75508 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CLDN11O75508 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CLDN11O75508 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CLDN11O75508 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CLDN11O75508 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CLDN11O75508 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLDN11O75508 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLDN11O75508 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLDN11O75508 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLDN11O75508 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLDN11O75508 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CLDN11O75508 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLDN11O75508 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDN11O75508 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDN11O75508 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDN11O75508 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDN11O75508 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDN11O75508 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDN11O75508 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDN11O75508 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDN11O75508 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDN11O75508 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDN11O75508 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDN11O75508 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDN11O75508 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLDN11O75508 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLDN11O75508 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLDN11O75508 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CLDN11O75508 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLDN11O75508 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLDN11O75508 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDN11O75508 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDN11O75508 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDN11O75508 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDN11O75508 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDN11O75508 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDN11O75508 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDN11O75508 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDN11O75508 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDN11O75508 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDN11O75508 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDN11O75508 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLDN11O75508 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLDN11O75508 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLDN11O75508 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLDN11O75508 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms