Protein–RNA interactions for Protein: O75487

GPC4, Glypican-4, humanhuman

Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC4O75487 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPC4O75487 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPC4O75487 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPC4O75487 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPC4O75487 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPC4O75487 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPC4O75487 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPC4O75487 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPC4O75487 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPC4O75487 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPC4O75487 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPC4O75487 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPC4O75487 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPC4O75487 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPC4O75487 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPC4O75487 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPC4O75487 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPC4O75487 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GPC4O75487 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPC4O75487 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPC4O75487 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPC4O75487 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPC4O75487 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPC4O75487 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPC4O75487 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPC4O75487 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPC4O75487 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPC4O75487 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPC4O75487 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPC4O75487 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPC4O75487 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPC4O75487 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPC4O75487 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPC4O75487 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPC4O75487 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPC4O75487 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPC4O75487 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GPC4O75487 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GPC4O75487 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GPC4O75487 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
GPC4O75487 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GPC4O75487 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPC4O75487 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPC4O75487 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPC4O75487 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPC4O75487 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPC4O75487 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPC4O75487 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPC4O75487 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GPC4O75487 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPC4O75487 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPC4O75487 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPC4O75487 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPC4O75487 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GPC4O75487 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPC4O75487 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPC4O75487 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPC4O75487 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPC4O75487 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPC4O75487 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPC4O75487 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPC4O75487 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPC4O75487 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPC4O75487 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPC4O75487 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPC4O75487 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GPC4O75487 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPC4O75487 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPC4O75487 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPC4O75487 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPC4O75487 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPC4O75487 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GPC4O75487 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPC4O75487 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPC4O75487 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GPC4O75487 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPC4O75487 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPC4O75487 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPC4O75487 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPC4O75487 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPC4O75487 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPC4O75487 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPC4O75487 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPC4O75487 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPC4O75487 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPC4O75487 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC4O75487 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC4O75487 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC4O75487 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC4O75487 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC4O75487 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC4O75487 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC4O75487 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC4O75487 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC4O75487 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC4O75487 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC4O75487 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC4O75487 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC4O75487 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPC4O75487 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms