Protein–RNA interactions for Protein: O75473

LGR5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR5O75473 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LGR5O75473 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LGR5O75473 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LGR5O75473 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LGR5O75473 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LGR5O75473 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LGR5O75473 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LGR5O75473 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LGR5O75473 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LGR5O75473 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LGR5O75473 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LGR5O75473 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LGR5O75473 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LGR5O75473 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LGR5O75473 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LGR5O75473 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LGR5O75473 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LGR5O75473 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LGR5O75473 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LGR5O75473 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LGR5O75473 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LGR5O75473 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LGR5O75473 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LGR5O75473 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LGR5O75473 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LGR5O75473 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LGR5O75473 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LGR5O75473 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LGR5O75473 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LGR5O75473 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LGR5O75473 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LGR5O75473 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
LGR5O75473 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LGR5O75473 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
LGR5O75473 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LGR5O75473 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
LGR5O75473 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LGR5O75473 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LGR5O75473 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LGR5O75473 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LGR5O75473 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LGR5O75473 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
LGR5O75473 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LGR5O75473 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LGR5O75473 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
LGR5O75473 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LGR5O75473 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LGR5O75473 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LGR5O75473 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LGR5O75473 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LGR5O75473 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LGR5O75473 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LGR5O75473 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LGR5O75473 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LGR5O75473 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LGR5O75473 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LGR5O75473 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LGR5O75473 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LGR5O75473 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LGR5O75473 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LGR5O75473 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LGR5O75473 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LGR5O75473 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LGR5O75473 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LGR5O75473 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LGR5O75473 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LGR5O75473 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LGR5O75473 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LGR5O75473 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LGR5O75473 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LGR5O75473 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LGR5O75473 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LGR5O75473 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LGR5O75473 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LGR5O75473 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LGR5O75473 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LGR5O75473 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LGR5O75473 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LGR5O75473 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LGR5O75473 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LGR5O75473 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LGR5O75473 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LGR5O75473 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LGR5O75473 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LGR5O75473 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LGR5O75473 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LGR5O75473 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LGR5O75473 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LGR5O75473 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LGR5O75473 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LGR5O75473 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LGR5O75473 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LGR5O75473 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LGR5O75473 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LGR5O75473 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LGR5O75473 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
LGR5O75473 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LGR5O75473 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LGR5O75473 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LGR5O75473 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms