Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2F6O75461 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2F6O75461 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2F6O75461 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2F6O75461 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2F6O75461 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2F6O75461 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2F6O75461 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2F6O75461 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2F6O75461 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2F6O75461 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2F6O75461 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2F6O75461 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2F6O75461 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
E2F6O75461 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2F6O75461 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2F6O75461 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2F6O75461 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2F6O75461 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2F6O75461 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2F6O75461 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
E2F6O75461 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
E2F6O75461 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
E2F6O75461 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
E2F6O75461 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
E2F6O75461 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
E2F6O75461 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
E2F6O75461 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
E2F6O75461 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
E2F6O75461 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
E2F6O75461 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
E2F6O75461 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
E2F6O75461 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E2F6O75461 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
E2F6O75461 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E2F6O75461 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
E2F6O75461 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
E2F6O75461 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E2F6O75461 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.32■■□□□ 1
E2F6O75461 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E2F6O75461 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E2F6O75461 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E2F6O75461 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E2F6O75461 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E2F6O75461 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E2F6O75461 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
E2F6O75461 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E2F6O75461 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
E2F6O75461 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.31■■□□□ 1
E2F6O75461 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
E2F6O75461 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.31■■□□□ 1
E2F6O75461 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
E2F6O75461 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E2F6O75461 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E2F6O75461 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E2F6O75461 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
E2F6O75461 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E2F6O75461 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.3■■□□□ 1
E2F6O75461 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E2F6O75461 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
E2F6O75461 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
E2F6O75461 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E2F6O75461 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E2F6O75461 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
E2F6O75461 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
E2F6O75461 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E2F6O75461 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E2F6O75461 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
E2F6O75461 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E2F6O75461 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E2F6O75461 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
E2F6O75461 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E2F6O75461 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E2F6O75461 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E2F6O75461 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E2F6O75461 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.29■■□□□ 1
E2F6O75461 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E2F6O75461 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E2F6O75461 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
E2F6O75461 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E2F6O75461 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
E2F6O75461 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E2F6O75461 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
E2F6O75461 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
E2F6O75461 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E2F6O75461 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
E2F6O75461 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
E2F6O75461 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
E2F6O75461 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
E2F6O75461 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E2F6O75461 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
E2F6O75461 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E2F6O75461 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E2F6O75461 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.27■■□□□ 1
E2F6O75461 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E2F6O75461 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E2F6O75461 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.27■■□□□ 1
E2F6O75461 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
E2F6O75461 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
E2F6O75461 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms