Protein–RNA interactions for Protein: O75192

PEX11A, Peroxisomal membrane protein 11A, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX11AO75192 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX11AO75192 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX11AO75192 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX11AO75192 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX11AO75192 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PEX11AO75192 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PEX11AO75192 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PEX11AO75192 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PEX11AO75192 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PEX11AO75192 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PEX11AO75192 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PEX11AO75192 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PEX11AO75192 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PEX11AO75192 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PEX11AO75192 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PEX11AO75192 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PEX11AO75192 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PEX11AO75192 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PEX11AO75192 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PEX11AO75192 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX11AO75192 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX11AO75192 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX11AO75192 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX11AO75192 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX11AO75192 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX11AO75192 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PEX11AO75192 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PEX11AO75192 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PEX11AO75192 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PEX11AO75192 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PEX11AO75192 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PEX11AO75192 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PEX11AO75192 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX11AO75192 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX11AO75192 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX11AO75192 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX11AO75192 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX11AO75192 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX11AO75192 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX11AO75192 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX11AO75192 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX11AO75192 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX11AO75192 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX11AO75192 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX11AO75192 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX11AO75192 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX11AO75192 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX11AO75192 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX11AO75192 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX11AO75192 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX11AO75192 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX11AO75192 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX11AO75192 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX11AO75192 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX11AO75192 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX11AO75192 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX11AO75192 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PEX11AO75192 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PEX11AO75192 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PEX11AO75192 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PEX11AO75192 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PEX11AO75192 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PEX11AO75192 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PEX11AO75192 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PEX11AO75192 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PEX11AO75192 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PEX11AO75192 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PEX11AO75192 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PEX11AO75192 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PEX11AO75192 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PEX11AO75192 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PEX11AO75192 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX11AO75192 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX11AO75192 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX11AO75192 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX11AO75192 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX11AO75192 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX11AO75192 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX11AO75192 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX11AO75192 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX11AO75192 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX11AO75192 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX11AO75192 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX11AO75192 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PEX11AO75192 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PEX11AO75192 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PEX11AO75192 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PEX11AO75192 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PEX11AO75192 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PEX11AO75192 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PEX11AO75192 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PEX11AO75192 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PEX11AO75192 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PEX11AO75192 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PEX11AO75192 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PEX11AO75192 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PEX11AO75192 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PEX11AO75192 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PEX11AO75192 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PEX11AO75192 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms