Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RAB11FIP3O75154 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
RAB11FIP3O75154 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RAB11FIP3O75154 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
RAB11FIP3O75154 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
RAB11FIP3O75154 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
RAB11FIP3O75154 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RAB11FIP3O75154 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RAB11FIP3O75154 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RAB11FIP3O75154 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RAB11FIP3O75154 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RAB11FIP3O75154 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RAB11FIP3O75154 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RAB11FIP3O75154 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RAB11FIP3O75154 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RAB11FIP3O75154 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RAB11FIP3O75154 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RAB11FIP3O75154 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RAB11FIP3O75154 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RAB11FIP3O75154 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RAB11FIP3O75154 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RAB11FIP3O75154 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RAB11FIP3O75154 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RAB11FIP3O75154 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RAB11FIP3O75154 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RAB11FIP3O75154 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RAB11FIP3O75154 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RAB11FIP3O75154 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RAB11FIP3O75154 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RAB11FIP3O75154 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RAB11FIP3O75154 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RAB11FIP3O75154 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RAB11FIP3O75154 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RAB11FIP3O75154 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
RAB11FIP3O75154 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RAB11FIP3O75154 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RAB11FIP3O75154 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RAB11FIP3O75154 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RAB11FIP3O75154 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RAB11FIP3O75154 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RAB11FIP3O75154 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RAB11FIP3O75154 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RAB11FIP3O75154 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RAB11FIP3O75154 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RAB11FIP3O75154 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RAB11FIP3O75154 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RAB11FIP3O75154 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RAB11FIP3O75154 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RAB11FIP3O75154 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RAB11FIP3O75154 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RAB11FIP3O75154 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RAB11FIP3O75154 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RAB11FIP3O75154 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RAB11FIP3O75154 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RAB11FIP3O75154 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RAB11FIP3O75154 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RAB11FIP3O75154 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAB11FIP3O75154 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAB11FIP3O75154 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAB11FIP3O75154 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAB11FIP3O75154 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAB11FIP3O75154 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAB11FIP3O75154 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAB11FIP3O75154 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAB11FIP3O75154 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAB11FIP3O75154 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAB11FIP3O75154 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAB11FIP3O75154 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAB11FIP3O75154 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAB11FIP3O75154 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAB11FIP3O75154 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAB11FIP3O75154 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAB11FIP3O75154 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAB11FIP3O75154 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAB11FIP3O75154 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAB11FIP3O75154 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAB11FIP3O75154 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAB11FIP3O75154 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAB11FIP3O75154 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAB11FIP3O75154 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAB11FIP3O75154 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAB11FIP3O75154 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAB11FIP3O75154 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAB11FIP3O75154 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
RAB11FIP3O75154 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAB11FIP3O75154 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAB11FIP3O75154 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
RAB11FIP3O75154 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
RAB11FIP3O75154 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
RAB11FIP3O75154 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
RAB11FIP3O75154 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAB11FIP3O75154 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAB11FIP3O75154 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAB11FIP3O75154 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAB11FIP3O75154 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAB11FIP3O75154 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAB11FIP3O75154 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAB11FIP3O75154 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAB11FIP3O75154 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAB11FIP3O75154 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms