Protein–RNA interactions for Protein: O60938

KERA, Keratocan, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KERAO60938 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KERAO60938 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KERAO60938 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KERAO60938 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KERAO60938 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KERAO60938 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KERAO60938 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KERAO60938 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KERAO60938 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KERAO60938 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KERAO60938 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KERAO60938 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KERAO60938 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KERAO60938 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KERAO60938 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KERAO60938 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KERAO60938 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KERAO60938 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KERAO60938 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KERAO60938 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KERAO60938 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KERAO60938 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KERAO60938 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KERAO60938 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KERAO60938 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KERAO60938 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KERAO60938 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KERAO60938 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KERAO60938 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KERAO60938 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KERAO60938 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KERAO60938 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KERAO60938 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KERAO60938 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KERAO60938 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KERAO60938 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KERAO60938 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KERAO60938 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KERAO60938 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KERAO60938 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KERAO60938 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KERAO60938 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KERAO60938 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KERAO60938 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KERAO60938 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KERAO60938 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KERAO60938 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KERAO60938 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KERAO60938 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KERAO60938 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KERAO60938 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KERAO60938 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KERAO60938 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KERAO60938 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KERAO60938 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KERAO60938 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KERAO60938 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KERAO60938 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KERAO60938 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KERAO60938 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KERAO60938 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KERAO60938 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KERAO60938 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KERAO60938 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KERAO60938 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KERAO60938 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KERAO60938 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KERAO60938 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KERAO60938 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KERAO60938 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KERAO60938 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KERAO60938 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KERAO60938 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KERAO60938 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KERAO60938 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KERAO60938 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KERAO60938 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KERAO60938 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KERAO60938 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KERAO60938 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KERAO60938 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KERAO60938 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KERAO60938 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KERAO60938 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KERAO60938 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KERAO60938 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KERAO60938 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KERAO60938 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KERAO60938 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KERAO60938 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KERAO60938 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KERAO60938 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KERAO60938 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KERAO60938 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KERAO60938 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KERAO60938 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KERAO60938 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KERAO60938 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KERAO60938 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KERAO60938 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms