Protein–RNA interactions for Protein: O60749

SNX2, Sorting nexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX2O60749 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX2O60749 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX2O60749 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX2O60749 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX2O60749 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX2O60749 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX2O60749 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX2O60749 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX2O60749 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX2O60749 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX2O60749 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX2O60749 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX2O60749 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX2O60749 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX2O60749 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX2O60749 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX2O60749 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX2O60749 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX2O60749 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SNX2O60749 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX2O60749 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX2O60749 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX2O60749 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX2O60749 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX2O60749 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX2O60749 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX2O60749 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX2O60749 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX2O60749 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX2O60749 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX2O60749 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX2O60749 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX2O60749 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX2O60749 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX2O60749 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX2O60749 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX2O60749 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX2O60749 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX2O60749 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX2O60749 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX2O60749 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX2O60749 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX2O60749 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX2O60749 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX2O60749 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX2O60749 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX2O60749 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX2O60749 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX2O60749 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX2O60749 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX2O60749 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX2O60749 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX2O60749 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX2O60749 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX2O60749 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX2O60749 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX2O60749 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX2O60749 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX2O60749 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX2O60749 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX2O60749 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX2O60749 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX2O60749 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX2O60749 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX2O60749 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX2O60749 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX2O60749 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX2O60749 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX2O60749 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX2O60749 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX2O60749 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX2O60749 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX2O60749 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX2O60749 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX2O60749 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX2O60749 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX2O60749 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX2O60749 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX2O60749 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX2O60749 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX2O60749 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX2O60749 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNX2O60749 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNX2O60749 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNX2O60749 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNX2O60749 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNX2O60749 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNX2O60749 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNX2O60749 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNX2O60749 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX2O60749 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX2O60749 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX2O60749 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX2O60749 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX2O60749 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX2O60749 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX2O60749 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX2O60749 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX2O60749 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX2O60749 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms