Protein–RNA interactions for Protein: O60383

GDF9, Growth/differentiation factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF9O60383 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GDF9O60383 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDF9O60383 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDF9O60383 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDF9O60383 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDF9O60383 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDF9O60383 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDF9O60383 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDF9O60383 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GDF9O60383 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDF9O60383 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDF9O60383 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDF9O60383 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDF9O60383 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDF9O60383 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDF9O60383 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDF9O60383 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDF9O60383 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDF9O60383 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDF9O60383 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDF9O60383 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDF9O60383 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDF9O60383 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GDF9O60383 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GDF9O60383 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GDF9O60383 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GDF9O60383 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDF9O60383 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GDF9O60383 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDF9O60383 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDF9O60383 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDF9O60383 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDF9O60383 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDF9O60383 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDF9O60383 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GDF9O60383 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDF9O60383 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDF9O60383 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDF9O60383 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDF9O60383 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDF9O60383 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDF9O60383 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GDF9O60383 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDF9O60383 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDF9O60383 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDF9O60383 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDF9O60383 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDF9O60383 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDF9O60383 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDF9O60383 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDF9O60383 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDF9O60383 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GDF9O60383 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDF9O60383 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDF9O60383 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDF9O60383 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDF9O60383 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDF9O60383 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDF9O60383 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDF9O60383 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDF9O60383 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDF9O60383 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDF9O60383 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDF9O60383 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDF9O60383 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GDF9O60383 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GDF9O60383 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GDF9O60383 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDF9O60383 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDF9O60383 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDF9O60383 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDF9O60383 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GDF9O60383 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDF9O60383 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GDF9O60383 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDF9O60383 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDF9O60383 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDF9O60383 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDF9O60383 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GDF9O60383 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDF9O60383 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDF9O60383 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GDF9O60383 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDF9O60383 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDF9O60383 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDF9O60383 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDF9O60383 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDF9O60383 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GDF9O60383 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDF9O60383 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDF9O60383 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDF9O60383 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDF9O60383 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDF9O60383 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDF9O60383 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GDF9O60383 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GDF9O60383 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDF9O60383 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDF9O60383 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDF9O60383 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms