Protein–RNA interactions for Protein: O60308

CEP104, Centrosomal protein of 104 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP104O60308 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CEP104O60308 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CEP104O60308 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CEP104O60308 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CEP104O60308 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CEP104O60308 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CEP104O60308 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CEP104O60308 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CEP104O60308 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CEP104O60308 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CEP104O60308 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CEP104O60308 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CEP104O60308 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CEP104O60308 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CEP104O60308 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CEP104O60308 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CEP104O60308 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CEP104O60308 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CEP104O60308 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CEP104O60308 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CEP104O60308 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CEP104O60308 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CEP104O60308 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CEP104O60308 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CEP104O60308 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CEP104O60308 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CEP104O60308 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CEP104O60308 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CEP104O60308 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CEP104O60308 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CEP104O60308 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CEP104O60308 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CEP104O60308 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CEP104O60308 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CEP104O60308 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CEP104O60308 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CEP104O60308 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CEP104O60308 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CEP104O60308 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CEP104O60308 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CEP104O60308 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
CEP104O60308 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CEP104O60308 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CEP104O60308 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CEP104O60308 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CEP104O60308 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CEP104O60308 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CEP104O60308 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CEP104O60308 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CEP104O60308 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CEP104O60308 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CEP104O60308 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CEP104O60308 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CEP104O60308 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CEP104O60308 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CEP104O60308 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CEP104O60308 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CEP104O60308 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CEP104O60308 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CEP104O60308 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CEP104O60308 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CEP104O60308 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CEP104O60308 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CEP104O60308 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CEP104O60308 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CEP104O60308 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CEP104O60308 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CEP104O60308 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CEP104O60308 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CEP104O60308 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CEP104O60308 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CEP104O60308 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CEP104O60308 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CEP104O60308 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CEP104O60308 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CEP104O60308 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CEP104O60308 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CEP104O60308 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CEP104O60308 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CEP104O60308 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CEP104O60308 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CEP104O60308 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CEP104O60308 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CEP104O60308 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CEP104O60308 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CEP104O60308 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CEP104O60308 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CEP104O60308 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CEP104O60308 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CEP104O60308 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CEP104O60308 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CEP104O60308 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CEP104O60308 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CEP104O60308 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CEP104O60308 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CEP104O60308 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CEP104O60308 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CEP104O60308 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CEP104O60308 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CEP104O60308 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms