Protein–RNA interactions for Protein: O43896

KIF1C, Kinesin-like protein KIF1C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF1CO43896 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KIF1CO43896 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KIF1CO43896 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KIF1CO43896 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KIF1CO43896 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KIF1CO43896 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KIF1CO43896 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KIF1CO43896 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KIF1CO43896 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KIF1CO43896 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIF1CO43896 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIF1CO43896 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIF1CO43896 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIF1CO43896 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIF1CO43896 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIF1CO43896 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIF1CO43896 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIF1CO43896 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIF1CO43896 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIF1CO43896 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIF1CO43896 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIF1CO43896 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIF1CO43896 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIF1CO43896 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIF1CO43896 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIF1CO43896 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIF1CO43896 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIF1CO43896 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIF1CO43896 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIF1CO43896 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIF1CO43896 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIF1CO43896 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIF1CO43896 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIF1CO43896 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIF1CO43896 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIF1CO43896 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIF1CO43896 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIF1CO43896 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIF1CO43896 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KIF1CO43896 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIF1CO43896 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIF1CO43896 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIF1CO43896 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIF1CO43896 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIF1CO43896 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIF1CO43896 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIF1CO43896 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIF1CO43896 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIF1CO43896 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KIF1CO43896 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIF1CO43896 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIF1CO43896 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIF1CO43896 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIF1CO43896 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIF1CO43896 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KIF1CO43896 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIF1CO43896 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIF1CO43896 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIF1CO43896 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIF1CO43896 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIF1CO43896 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIF1CO43896 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIF1CO43896 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIF1CO43896 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIF1CO43896 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIF1CO43896 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KIF1CO43896 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIF1CO43896 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIF1CO43896 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIF1CO43896 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIF1CO43896 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIF1CO43896 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIF1CO43896 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIF1CO43896 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIF1CO43896 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIF1CO43896 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIF1CO43896 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIF1CO43896 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIF1CO43896 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIF1CO43896 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KIF1CO43896 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIF1CO43896 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIF1CO43896 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIF1CO43896 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIF1CO43896 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIF1CO43896 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIF1CO43896 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KIF1CO43896 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIF1CO43896 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIF1CO43896 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KIF1CO43896 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KIF1CO43896 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIF1CO43896 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KIF1CO43896 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIF1CO43896 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIF1CO43896 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIF1CO43896 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIF1CO43896 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIF1CO43896 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIF1CO43896 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms