Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYNGR3O43761 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYNGR3O43761 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYNGR3O43761 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYNGR3O43761 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYNGR3O43761 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SYNGR3O43761 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYNGR3O43761 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYNGR3O43761 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYNGR3O43761 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYNGR3O43761 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYNGR3O43761 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYNGR3O43761 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYNGR3O43761 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYNGR3O43761 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYNGR3O43761 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYNGR3O43761 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SYNGR3O43761 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYNGR3O43761 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYNGR3O43761 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYNGR3O43761 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYNGR3O43761 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNGR3O43761 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNGR3O43761 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNGR3O43761 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNGR3O43761 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNGR3O43761 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNGR3O43761 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNGR3O43761 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNGR3O43761 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNGR3O43761 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNGR3O43761 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNGR3O43761 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNGR3O43761 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNGR3O43761 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNGR3O43761 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNGR3O43761 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNGR3O43761 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNGR3O43761 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNGR3O43761 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNGR3O43761 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
SYNGR3O43761 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SYNGR3O43761 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SYNGR3O43761 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SYNGR3O43761 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SYNGR3O43761 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SYNGR3O43761 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SYNGR3O43761 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SYNGR3O43761 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SYNGR3O43761 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SYNGR3O43761 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SYNGR3O43761 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SYNGR3O43761 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SYNGR3O43761 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYNGR3O43761 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYNGR3O43761 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYNGR3O43761 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYNGR3O43761 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SYNGR3O43761 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SYNGR3O43761 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYNGR3O43761 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYNGR3O43761 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYNGR3O43761 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SYNGR3O43761 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SYNGR3O43761 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SYNGR3O43761 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SYNGR3O43761 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SYNGR3O43761 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SYNGR3O43761 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SYNGR3O43761 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SYNGR3O43761 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SYNGR3O43761 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SYNGR3O43761 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SYNGR3O43761 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SYNGR3O43761 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SYNGR3O43761 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SYNGR3O43761 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SYNGR3O43761 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SYNGR3O43761 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SYNGR3O43761 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SYNGR3O43761 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SYNGR3O43761 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYNGR3O43761 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYNGR3O43761 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYNGR3O43761 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYNGR3O43761 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYNGR3O43761 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYNGR3O43761 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYNGR3O43761 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYNGR3O43761 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYNGR3O43761 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYNGR3O43761 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYNGR3O43761 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYNGR3O43761 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYNGR3O43761 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYNGR3O43761 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYNGR3O43761 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYNGR3O43761 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYNGR3O43761 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYNGR3O43761 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms