Protein–RNA interactions for Protein: O43709

BUD23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BUD23O43709 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BUD23O43709 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BUD23O43709 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BUD23O43709 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BUD23O43709 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
BUD23O43709 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BUD23O43709 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BUD23O43709 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BUD23O43709 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BUD23O43709 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BUD23O43709 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BUD23O43709 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
BUD23O43709 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
BUD23O43709 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BUD23O43709 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BUD23O43709 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BUD23O43709 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BUD23O43709 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BUD23O43709 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BUD23O43709 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BUD23O43709 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BUD23O43709 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
BUD23O43709 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BUD23O43709 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BUD23O43709 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BUD23O43709 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BUD23O43709 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BUD23O43709 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BUD23O43709 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BUD23O43709 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BUD23O43709 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BUD23O43709 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BUD23O43709 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BUD23O43709 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BUD23O43709 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BUD23O43709 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BUD23O43709 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BUD23O43709 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BUD23O43709 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BUD23O43709 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BUD23O43709 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BUD23O43709 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BUD23O43709 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BUD23O43709 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BUD23O43709 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BUD23O43709 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
BUD23O43709 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BUD23O43709 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BUD23O43709 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BUD23O43709 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BUD23O43709 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BUD23O43709 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BUD23O43709 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BUD23O43709 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BUD23O43709 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BUD23O43709 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BUD23O43709 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BUD23O43709 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BUD23O43709 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BUD23O43709 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BUD23O43709 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BUD23O43709 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BUD23O43709 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BUD23O43709 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BUD23O43709 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BUD23O43709 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BUD23O43709 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BUD23O43709 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BUD23O43709 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BUD23O43709 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BUD23O43709 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BUD23O43709 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BUD23O43709 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BUD23O43709 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BUD23O43709 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BUD23O43709 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BUD23O43709 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BUD23O43709 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BUD23O43709 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BUD23O43709 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BUD23O43709 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BUD23O43709 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
BUD23O43709 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
BUD23O43709 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
BUD23O43709 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
BUD23O43709 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BUD23O43709 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BUD23O43709 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BUD23O43709 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BUD23O43709 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BUD23O43709 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BUD23O43709 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BUD23O43709 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BUD23O43709 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BUD23O43709 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BUD23O43709 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BUD23O43709 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BUD23O43709 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BUD23O43709 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BUD23O43709 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms