Protein–RNA interactions for Protein: O43633

CHMP2A, Charged multivesicular body protein 2a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2AO43633 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMP2AO43633 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMP2AO43633 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMP2AO43633 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMP2AO43633 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMP2AO43633 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMP2AO43633 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMP2AO43633 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMP2AO43633 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMP2AO43633 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMP2AO43633 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMP2AO43633 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMP2AO43633 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHMP2AO43633 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHMP2AO43633 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHMP2AO43633 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHMP2AO43633 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHMP2AO43633 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHMP2AO43633 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CHMP2AO43633 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHMP2AO43633 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHMP2AO43633 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHMP2AO43633 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHMP2AO43633 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHMP2AO43633 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHMP2AO43633 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHMP2AO43633 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHMP2AO43633 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHMP2AO43633 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHMP2AO43633 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHMP2AO43633 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHMP2AO43633 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHMP2AO43633 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHMP2AO43633 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHMP2AO43633 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CHMP2AO43633 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHMP2AO43633 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHMP2AO43633 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
CHMP2AO43633 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHMP2AO43633 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHMP2AO43633 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHMP2AO43633 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHMP2AO43633 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHMP2AO43633 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHMP2AO43633 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHMP2AO43633 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CHMP2AO43633 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHMP2AO43633 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHMP2AO43633 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHMP2AO43633 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHMP2AO43633 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHMP2AO43633 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHMP2AO43633 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHMP2AO43633 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHMP2AO43633 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHMP2AO43633 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHMP2AO43633 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHMP2AO43633 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHMP2AO43633 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHMP2AO43633 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CHMP2AO43633 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHMP2AO43633 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHMP2AO43633 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHMP2AO43633 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHMP2AO43633 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CHMP2AO43633 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHMP2AO43633 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHMP2AO43633 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHMP2AO43633 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHMP2AO43633 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHMP2AO43633 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHMP2AO43633 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHMP2AO43633 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHMP2AO43633 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHMP2AO43633 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHMP2AO43633 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHMP2AO43633 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHMP2AO43633 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHMP2AO43633 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHMP2AO43633 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHMP2AO43633 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHMP2AO43633 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHMP2AO43633 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHMP2AO43633 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHMP2AO43633 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHMP2AO43633 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHMP2AO43633 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CHMP2AO43633 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
CHMP2AO43633 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CHMP2AO43633 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CHMP2AO43633 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHMP2AO43633 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHMP2AO43633 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHMP2AO43633 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHMP2AO43633 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHMP2AO43633 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHMP2AO43633 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHMP2AO43633 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHMP2AO43633 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHMP2AO43633 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms