Protein–RNA interactions for Protein: O43615

TIMM44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM44O43615 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TIMM44O43615 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TIMM44O43615 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TIMM44O43615 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TIMM44O43615 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TIMM44O43615 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TIMM44O43615 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TIMM44O43615 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TIMM44O43615 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TIMM44O43615 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TIMM44O43615 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TIMM44O43615 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TIMM44O43615 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TIMM44O43615 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TIMM44O43615 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TIMM44O43615 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TIMM44O43615 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TIMM44O43615 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TIMM44O43615 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TIMM44O43615 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TIMM44O43615 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TIMM44O43615 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TIMM44O43615 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TIMM44O43615 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TIMM44O43615 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TIMM44O43615 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TIMM44O43615 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TIMM44O43615 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TIMM44O43615 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TIMM44O43615 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TIMM44O43615 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TIMM44O43615 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TIMM44O43615 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TIMM44O43615 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TIMM44O43615 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TIMM44O43615 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TIMM44O43615 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TIMM44O43615 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TIMM44O43615 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TIMM44O43615 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TIMM44O43615 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TIMM44O43615 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TIMM44O43615 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TIMM44O43615 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TIMM44O43615 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TIMM44O43615 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TIMM44O43615 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TIMM44O43615 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TIMM44O43615 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TIMM44O43615 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TIMM44O43615 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TIMM44O43615 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TIMM44O43615 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TIMM44O43615 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TIMM44O43615 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TIMM44O43615 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TIMM44O43615 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TIMM44O43615 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TIMM44O43615 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TIMM44O43615 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TIMM44O43615 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TIMM44O43615 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TIMM44O43615 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TIMM44O43615 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TIMM44O43615 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TIMM44O43615 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TIMM44O43615 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TIMM44O43615 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TIMM44O43615 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TIMM44O43615 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TIMM44O43615 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TIMM44O43615 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TIMM44O43615 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TIMM44O43615 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TIMM44O43615 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TIMM44O43615 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TIMM44O43615 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TIMM44O43615 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TIMM44O43615 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TIMM44O43615 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TIMM44O43615 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TIMM44O43615 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TIMM44O43615 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TIMM44O43615 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TIMM44O43615 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TIMM44O43615 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TIMM44O43615 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TIMM44O43615 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TIMM44O43615 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TIMM44O43615 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TIMM44O43615 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TIMM44O43615 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TIMM44O43615 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TIMM44O43615 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TIMM44O43615 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TIMM44O43615 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TIMM44O43615 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TIMM44O43615 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TIMM44O43615 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TIMM44O43615 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms