Protein–RNA interactions for Protein: O43502

RAD51C, DNA repair protein RAD51 homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51CO43502 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD51CO43502 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD51CO43502 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD51CO43502 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD51CO43502 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD51CO43502 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD51CO43502 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD51CO43502 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD51CO43502 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD51CO43502 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD51CO43502 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD51CO43502 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD51CO43502 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD51CO43502 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD51CO43502 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD51CO43502 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD51CO43502 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD51CO43502 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD51CO43502 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD51CO43502 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD51CO43502 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD51CO43502 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD51CO43502 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD51CO43502 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD51CO43502 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD51CO43502 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD51CO43502 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD51CO43502 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD51CO43502 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD51CO43502 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD51CO43502 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD51CO43502 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD51CO43502 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAD51CO43502 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAD51CO43502 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAD51CO43502 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAD51CO43502 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAD51CO43502 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAD51CO43502 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAD51CO43502 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAD51CO43502 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RAD51CO43502 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAD51CO43502 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAD51CO43502 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAD51CO43502 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAD51CO43502 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAD51CO43502 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAD51CO43502 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAD51CO43502 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAD51CO43502 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAD51CO43502 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD51CO43502 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD51CO43502 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD51CO43502 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD51CO43502 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD51CO43502 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD51CO43502 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD51CO43502 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD51CO43502 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD51CO43502 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD51CO43502 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD51CO43502 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD51CO43502 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD51CO43502 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD51CO43502 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD51CO43502 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD51CO43502 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD51CO43502 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD51CO43502 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD51CO43502 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD51CO43502 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD51CO43502 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD51CO43502 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD51CO43502 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD51CO43502 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD51CO43502 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD51CO43502 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD51CO43502 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD51CO43502 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD51CO43502 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD51CO43502 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD51CO43502 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD51CO43502 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD51CO43502 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD51CO43502 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD51CO43502 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD51CO43502 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD51CO43502 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD51CO43502 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD51CO43502 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD51CO43502 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD51CO43502 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD51CO43502 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD51CO43502 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD51CO43502 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD51CO43502 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD51CO43502 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD51CO43502 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RAD51CO43502 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAD51CO43502 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms