Protein–RNA interactions for Protein: O43439

CBFA2T2, Protein CBFA2T2, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFA2T2O43439 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CBFA2T2O43439 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CBFA2T2O43439 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CBFA2T2O43439 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CBFA2T2O43439 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CBFA2T2O43439 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CBFA2T2O43439 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CBFA2T2O43439 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CBFA2T2O43439 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CBFA2T2O43439 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CBFA2T2O43439 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CBFA2T2O43439 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CBFA2T2O43439 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CBFA2T2O43439 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CBFA2T2O43439 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CBFA2T2O43439 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CBFA2T2O43439 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CBFA2T2O43439 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CBFA2T2O43439 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CBFA2T2O43439 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CBFA2T2O43439 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CBFA2T2O43439 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CBFA2T2O43439 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CBFA2T2O43439 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CBFA2T2O43439 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CBFA2T2O43439 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CBFA2T2O43439 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CBFA2T2O43439 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CBFA2T2O43439 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CBFA2T2O43439 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CBFA2T2O43439 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CBFA2T2O43439 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CBFA2T2O43439 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CBFA2T2O43439 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CBFA2T2O43439 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CBFA2T2O43439 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CBFA2T2O43439 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CBFA2T2O43439 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CBFA2T2O43439 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CBFA2T2O43439 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CBFA2T2O43439 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CBFA2T2O43439 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CBFA2T2O43439 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CBFA2T2O43439 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CBFA2T2O43439 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CBFA2T2O43439 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CBFA2T2O43439 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CBFA2T2O43439 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CBFA2T2O43439 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CBFA2T2O43439 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CBFA2T2O43439 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CBFA2T2O43439 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CBFA2T2O43439 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CBFA2T2O43439 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CBFA2T2O43439 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CBFA2T2O43439 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CBFA2T2O43439 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CBFA2T2O43439 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CBFA2T2O43439 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CBFA2T2O43439 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CBFA2T2O43439 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CBFA2T2O43439 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CBFA2T2O43439 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CBFA2T2O43439 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CBFA2T2O43439 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CBFA2T2O43439 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CBFA2T2O43439 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CBFA2T2O43439 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CBFA2T2O43439 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CBFA2T2O43439 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CBFA2T2O43439 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CBFA2T2O43439 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CBFA2T2O43439 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CBFA2T2O43439 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CBFA2T2O43439 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CBFA2T2O43439 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CBFA2T2O43439 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CBFA2T2O43439 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CBFA2T2O43439 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CBFA2T2O43439 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CBFA2T2O43439 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CBFA2T2O43439 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CBFA2T2O43439 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CBFA2T2O43439 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CBFA2T2O43439 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CBFA2T2O43439 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CBFA2T2O43439 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CBFA2T2O43439 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CBFA2T2O43439 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CBFA2T2O43439 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CBFA2T2O43439 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CBFA2T2O43439 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CBFA2T2O43439 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CBFA2T2O43439 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CBFA2T2O43439 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CBFA2T2O43439 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CBFA2T2O43439 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CBFA2T2O43439 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CBFA2T2O43439 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CBFA2T2O43439 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms