Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRPF3O43395 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PRPF3O43395 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRPF3O43395 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRPF3O43395 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRPF3O43395 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRPF3O43395 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PRPF3O43395 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRPF3O43395 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRPF3O43395 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRPF3O43395 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRPF3O43395 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRPF3O43395 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRPF3O43395 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRPF3O43395 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRPF3O43395 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRPF3O43395 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRPF3O43395 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRPF3O43395 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRPF3O43395 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRPF3O43395 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRPF3O43395 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRPF3O43395 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRPF3O43395 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRPF3O43395 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRPF3O43395 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRPF3O43395 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRPF3O43395 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRPF3O43395 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRPF3O43395 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRPF3O43395 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRPF3O43395 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRPF3O43395 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRPF3O43395 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRPF3O43395 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRPF3O43395 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRPF3O43395 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRPF3O43395 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRPF3O43395 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRPF3O43395 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRPF3O43395 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRPF3O43395 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
PRPF3O43395 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRPF3O43395 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRPF3O43395 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRPF3O43395 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRPF3O43395 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRPF3O43395 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRPF3O43395 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRPF3O43395 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRPF3O43395 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRPF3O43395 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRPF3O43395 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRPF3O43395 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRPF3O43395 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRPF3O43395 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRPF3O43395 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PRPF3O43395 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRPF3O43395 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRPF3O43395 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRPF3O43395 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRPF3O43395 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRPF3O43395 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRPF3O43395 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRPF3O43395 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRPF3O43395 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRPF3O43395 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRPF3O43395 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRPF3O43395 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRPF3O43395 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRPF3O43395 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRPF3O43395 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PRPF3O43395 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRPF3O43395 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRPF3O43395 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRPF3O43395 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRPF3O43395 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRPF3O43395 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRPF3O43395 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRPF3O43395 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRPF3O43395 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRPF3O43395 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PRPF3O43395 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PRPF3O43395 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PRPF3O43395 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PRPF3O43395 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRPF3O43395 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRPF3O43395 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRPF3O43395 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRPF3O43395 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRPF3O43395 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRPF3O43395 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRPF3O43395 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRPF3O43395 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRPF3O43395 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRPF3O43395 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRPF3O43395 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRPF3O43395 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRPF3O43395 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRPF3O43395 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms