Protein–RNA interactions for Protein: O43323

DHH, Desert hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHHO43323 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DHHO43323 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DHHO43323 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DHHO43323 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DHHO43323 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DHHO43323 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DHHO43323 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DHHO43323 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DHHO43323 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DHHO43323 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DHHO43323 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
DHHO43323 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DHHO43323 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DHHO43323 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DHHO43323 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DHHO43323 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DHHO43323 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DHHO43323 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DHHO43323 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DHHO43323 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
DHHO43323 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DHHO43323 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DHHO43323 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DHHO43323 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DHHO43323 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DHHO43323 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DHHO43323 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DHHO43323 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DHHO43323 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DHHO43323 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DHHO43323 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DHHO43323 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DHHO43323 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DHHO43323 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DHHO43323 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DHHO43323 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DHHO43323 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DHHO43323 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DHHO43323 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DHHO43323 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DHHO43323 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DHHO43323 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DHHO43323 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DHHO43323 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DHHO43323 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DHHO43323 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DHHO43323 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DHHO43323 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DHHO43323 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DHHO43323 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DHHO43323 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DHHO43323 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DHHO43323 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DHHO43323 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DHHO43323 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DHHO43323 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DHHO43323 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DHHO43323 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DHHO43323 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DHHO43323 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DHHO43323 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DHHO43323 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DHHO43323 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DHHO43323 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DHHO43323 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DHHO43323 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DHHO43323 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DHHO43323 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DHHO43323 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DHHO43323 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DHHO43323 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
DHHO43323 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DHHO43323 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DHHO43323 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DHHO43323 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DHHO43323 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DHHO43323 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DHHO43323 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DHHO43323 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DHHO43323 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DHHO43323 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DHHO43323 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DHHO43323 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DHHO43323 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DHHO43323 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DHHO43323 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DHHO43323 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
DHHO43323 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DHHO43323 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DHHO43323 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DHHO43323 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DHHO43323 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DHHO43323 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DHHO43323 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DHHO43323 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DHHO43323 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DHHO43323 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DHHO43323 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DHHO43323 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DHHO43323 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms