Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTSS1O43312 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTSS1O43312 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTSS1O43312 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTSS1O43312 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTSS1O43312 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTSS1O43312 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTSS1O43312 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTSS1O43312 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTSS1O43312 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MTSS1O43312 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTSS1O43312 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTSS1O43312 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTSS1O43312 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MTSS1O43312 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTSS1O43312 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTSS1O43312 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTSS1O43312 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MTSS1O43312 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MTSS1O43312 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTSS1O43312 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTSS1O43312 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTSS1O43312 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTSS1O43312 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTSS1O43312 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTSS1O43312 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MTSS1O43312 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTSS1O43312 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTSS1O43312 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTSS1O43312 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTSS1O43312 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTSS1O43312 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTSS1O43312 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTSS1O43312 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTSS1O43312 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTSS1O43312 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTSS1O43312 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTSS1O43312 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTSS1O43312 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTSS1O43312 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTSS1O43312 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTSS1O43312 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTSS1O43312 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTSS1O43312 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTSS1O43312 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
MTSS1O43312 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTSS1O43312 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTSS1O43312 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTSS1O43312 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTSS1O43312 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTSS1O43312 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MTSS1O43312 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTSS1O43312 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTSS1O43312 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTSS1O43312 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTSS1O43312 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTSS1O43312 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTSS1O43312 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTSS1O43312 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTSS1O43312 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTSS1O43312 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTSS1O43312 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTSS1O43312 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTSS1O43312 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTSS1O43312 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTSS1O43312 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTSS1O43312 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTSS1O43312 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTSS1O43312 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTSS1O43312 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTSS1O43312 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTSS1O43312 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTSS1O43312 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MTSS1O43312 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTSS1O43312 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTSS1O43312 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTSS1O43312 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTSS1O43312 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MTSS1O43312 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTSS1O43312 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTSS1O43312 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MTSS1O43312 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTSS1O43312 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTSS1O43312 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTSS1O43312 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTSS1O43312 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTSS1O43312 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTSS1O43312 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MTSS1O43312 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTSS1O43312 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTSS1O43312 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTSS1O43312 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTSS1O43312 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTSS1O43312 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTSS1O43312 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTSS1O43312 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTSS1O43312 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTSS1O43312 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTSS1O43312 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTSS1O43312 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms