Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PHF1O43189 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PHF1O43189 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PHF1O43189 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PHF1O43189 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PHF1O43189 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PHF1O43189 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PHF1O43189 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PHF1O43189 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PHF1O43189 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PHF1O43189 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PHF1O43189 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PHF1O43189 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PHF1O43189 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PHF1O43189 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PHF1O43189 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PHF1O43189 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PHF1O43189 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PHF1O43189 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PHF1O43189 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PHF1O43189 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PHF1O43189 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PHF1O43189 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PHF1O43189 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PHF1O43189 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PHF1O43189 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PHF1O43189 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PHF1O43189 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PHF1O43189 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PHF1O43189 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PHF1O43189 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PHF1O43189 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PHF1O43189 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PHF1O43189 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PHF1O43189 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PHF1O43189 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PHF1O43189 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PHF1O43189 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PHF1O43189 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PHF1O43189 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PHF1O43189 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PHF1O43189 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PHF1O43189 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PHF1O43189 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PHF1O43189 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PHF1O43189 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PHF1O43189 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PHF1O43189 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PHF1O43189 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PHF1O43189 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PHF1O43189 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PHF1O43189 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PHF1O43189 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PHF1O43189 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PHF1O43189 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PHF1O43189 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PHF1O43189 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF1O43189 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF1O43189 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF1O43189 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF1O43189 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF1O43189 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF1O43189 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF1O43189 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF1O43189 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF1O43189 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF1O43189 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF1O43189 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF1O43189 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF1O43189 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PHF1O43189 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHF1O43189 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHF1O43189 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHF1O43189 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHF1O43189 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHF1O43189 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHF1O43189 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHF1O43189 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHF1O43189 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHF1O43189 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PHF1O43189 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PHF1O43189 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PHF1O43189 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PHF1O43189 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PHF1O43189 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PHF1O43189 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PHF1O43189 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PHF1O43189 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PHF1O43189 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PHF1O43189 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PHF1O43189 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PHF1O43189 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PHF1O43189 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PHF1O43189 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PHF1O43189 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PHF1O43189 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PHF1O43189 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PHF1O43189 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PHF1O43189 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PHF1O43189 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms