Protein–RNA interactions for Protein: O43175

PHGDH, D-3-phosphoglycerate dehydrogenase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHGDHO43175 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHGDHO43175 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHGDHO43175 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHGDHO43175 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHGDHO43175 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHGDHO43175 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHGDHO43175 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PHGDHO43175 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHGDHO43175 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHGDHO43175 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHGDHO43175 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PHGDHO43175 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHGDHO43175 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHGDHO43175 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHGDHO43175 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHGDHO43175 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHGDHO43175 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHGDHO43175 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHGDHO43175 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHGDHO43175 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHGDHO43175 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHGDHO43175 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHGDHO43175 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHGDHO43175 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHGDHO43175 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHGDHO43175 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHGDHO43175 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHGDHO43175 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHGDHO43175 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHGDHO43175 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PHGDHO43175 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHGDHO43175 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHGDHO43175 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHGDHO43175 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHGDHO43175 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHGDHO43175 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHGDHO43175 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHGDHO43175 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHGDHO43175 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHGDHO43175 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHGDHO43175 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHGDHO43175 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHGDHO43175 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHGDHO43175 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHGDHO43175 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHGDHO43175 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHGDHO43175 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHGDHO43175 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHGDHO43175 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHGDHO43175 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHGDHO43175 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHGDHO43175 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHGDHO43175 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHGDHO43175 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHGDHO43175 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHGDHO43175 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHGDHO43175 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PHGDHO43175 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHGDHO43175 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHGDHO43175 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHGDHO43175 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHGDHO43175 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHGDHO43175 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHGDHO43175 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHGDHO43175 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHGDHO43175 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHGDHO43175 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHGDHO43175 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHGDHO43175 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHGDHO43175 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHGDHO43175 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHGDHO43175 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHGDHO43175 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHGDHO43175 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHGDHO43175 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PHGDHO43175 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PHGDHO43175 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PHGDHO43175 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHGDHO43175 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHGDHO43175 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHGDHO43175 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHGDHO43175 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHGDHO43175 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PHGDHO43175 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHGDHO43175 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHGDHO43175 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHGDHO43175 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHGDHO43175 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PHGDHO43175 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHGDHO43175 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHGDHO43175 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHGDHO43175 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHGDHO43175 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHGDHO43175 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PHGDHO43175 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHGDHO43175 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHGDHO43175 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHGDHO43175 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHGDHO43175 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHGDHO43175 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms