Protein–RNA interactions for Protein: O43149

ZZEF1, Zinc finger ZZ-type and EF-hand domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZZEF1O43149 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZZEF1O43149 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZZEF1O43149 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZZEF1O43149 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZZEF1O43149 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZZEF1O43149 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZZEF1O43149 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZZEF1O43149 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZZEF1O43149 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZZEF1O43149 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZZEF1O43149 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZZEF1O43149 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZZEF1O43149 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZZEF1O43149 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZZEF1O43149 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ZZEF1O43149 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZZEF1O43149 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZZEF1O43149 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZZEF1O43149 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZZEF1O43149 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZZEF1O43149 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZZEF1O43149 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZZEF1O43149 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZZEF1O43149 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZZEF1O43149 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZZEF1O43149 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZZEF1O43149 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZZEF1O43149 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZZEF1O43149 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZZEF1O43149 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZZEF1O43149 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZZEF1O43149 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZZEF1O43149 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZZEF1O43149 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZZEF1O43149 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZZEF1O43149 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ZZEF1O43149 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZZEF1O43149 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZZEF1O43149 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZZEF1O43149 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZZEF1O43149 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZZEF1O43149 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZZEF1O43149 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZZEF1O43149 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZZEF1O43149 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZZEF1O43149 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZZEF1O43149 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZZEF1O43149 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZZEF1O43149 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ZZEF1O43149 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ZZEF1O43149 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZZEF1O43149 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZZEF1O43149 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZZEF1O43149 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZZEF1O43149 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZZEF1O43149 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZZEF1O43149 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZZEF1O43149 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZZEF1O43149 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZZEF1O43149 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZZEF1O43149 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZZEF1O43149 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZZEF1O43149 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZZEF1O43149 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
ZZEF1O43149 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZZEF1O43149 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZZEF1O43149 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZZEF1O43149 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZZEF1O43149 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZZEF1O43149 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZZEF1O43149 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZZEF1O43149 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZZEF1O43149 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZZEF1O43149 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZZEF1O43149 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZZEF1O43149 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZZEF1O43149 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZZEF1O43149 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZZEF1O43149 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZZEF1O43149 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZZEF1O43149 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZZEF1O43149 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZZEF1O43149 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZZEF1O43149 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZZEF1O43149 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZZEF1O43149 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZZEF1O43149 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZZEF1O43149 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZZEF1O43149 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZZEF1O43149 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZZEF1O43149 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZZEF1O43149 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZZEF1O43149 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZZEF1O43149 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZZEF1O43149 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZZEF1O43149 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZZEF1O43149 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZZEF1O43149 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZZEF1O43149 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZZEF1O43149 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms